Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 BAIAP2-226ENST00000576364 542 ntTSL 58.64□□□□□ -1.032e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-213ENST00000573659 578 ntTSL 47.49□□□□□ -1.212e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-212ENST00000573017 574 ntTSL 47.11□□□□□ -1.272e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-211ENST00000572918 626 ntTSL 45.68□□□□□ -1.52e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 RNA5-8SP6-201ENST00000515896 152 ntBASIC8.08□□□□□ -1.122e-10■■■■■ 33.5
SRSF7Q16629 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-10■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.292e-10■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 TRIM24-206ENST00000497516 1515 ntTSL 511.79□□□□□ -0.522e-10■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 STRN3-203ENST00000366206 575 ntTSL 49.38□□□□□ -0.912e-10■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.022e-10■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 SP1-202ENST00000426431 7603 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.032e-13■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 UTRN-203ENST00000367526 3220 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.132e-10■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 STRN3-205ENST00000554991 417 ntTSL 56.67□□□□□ -1.342e-10■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 STRN3-208ENST00000556577 514 ntTSL 56.57□□□□□ -1.362e-10■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 CDK6-203ENST00000467166 779 ntTSL 25.76□□□□□ -1.492e-10■■■■■ 33.1
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SRSF7Q16629 EIF4A2-223ENST00000494445 629 ntTSL 26.92□□□□□ -1.34e-13■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 EIF4A2-203ENST00000426808 1751 ntTSL 1 (best)6.23□□□□□ -1.414e-13■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 EIF4A2-216ENST00000468362 1356 ntTSL 26.02□□□□□ -1.458e-9■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.514e-13■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 EIF4A2-207ENST00000443963 1729 ntTSL 1 (best)5.59□□□□□ -1.514e-13■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 EIF4A2-209ENST00000461021 575 ntTSL 25.15□□□□□ -1.598e-9■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 EIF4A2-202ENST00000425053 1977 ntTSL 55.09□□□□□ -1.594e-13■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 EIF4A2-222ENST00000492144 993 ntTSL 24.89□□□□□ -1.638e-9■■■■■ 33.1
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SRSF7Q16629 EIF4A2-226ENST00000497177 849 ntTSL 54.8□□□□□ -1.648e-9■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 EIF4A2-219ENST00000485101 5327 ntTSL 53.65□□□□□ -1.824e-13■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 ITIH2-202ENST00000379587 2848 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 32.5
SRSF7Q16629 ITIH2-201ENST00000358415 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 32.5
SRSF7Q16629 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.674e-10■■■■■ 32.4
SRSF7Q16629 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.761e-20■■■■■ 32.4
SRSF7Q16629 ZHX2-202ENST00000534247 873 ntTSL 35.03□□□□□ -1.64e-10■■■■■ 32.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-216ENST00000583503 641 ntTSL 313.68□□□□□ -0.225e-8■■■■■ 31.8
SRSF7Q16629 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.937e-10■■■■■ 31.8
SRSF7Q16629 MACROD1-208ENST00000545464 899 ntTSL 319.01■□□□□ 0.637e-10■■■■■ 31.8
SRSF7Q16629 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.526e-7■■■■■ 31.8
SRSF7Q16629 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.376e-7■■■■■ 31.8
SRSF7Q16629 SPPL2B-204ENST00000587851 586 ntTSL 317.08■□□□□ 0.326e-7■■■■■ 31.8
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SRSF7Q16629 SPPL2B-203ENST00000586332 496 ntTSL 313.08□□□□□ -0.326e-7■■■■■ 31.8
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SRSF7Q16629 MACROD1-206ENST00000542359 459 ntTSL 311.9□□□□□ -0.57e-10■■■■■ 31.8
SRSF7Q16629 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.556e-7■■■■■ 31.8
SRSF7Q16629 AGRN-202ENST00000419249 861 ntTSL 314.75□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 31.4
SRSF7Q16629 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 31.4
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SRSF7Q16629 AGRN-203ENST00000461111 3385 ntTSL 1 (best)10.34□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 31.4
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SRSF7Q16629 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 31.2
SRSF7Q16629 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 31.2
SRSF7Q16629 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 31.2
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SRSF7Q16629 TMEM2-204ENST00000377057 2637 ntTSL 28.69□□□□□ -1.021e-9■■■■■ 31.1
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SRSF7Q16629 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.482e-7■■■■■ 30.9
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SRSF7Q16629 HMGB2-205ENST00000511316 1841 ntTSL 211.1□□□□□ -0.634e-23■■■■■ 30.6
SRSF7Q16629 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.874e-23■■■■■ 30.6
SRSF7Q16629 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.374e-23■■■■■ 30.6
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SRSF7Q16629 QRICH2-201ENST00000262765 5357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.811e-10■■■■■ 30.6
SRSF7Q16629 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 30.3
SRSF7Q16629 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 30.3
SRSF7Q16629 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 30.3
SRSF7Q16629 VAV2-205ENST00000486113 523 ntTSL 210.02□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 30.3
SRSF7Q16629 GREB1-210ENST00000628795 438 ntTSL 54.11□□□□□ -1.757e-9■■■■■ 29.9
SRSF7Q16629 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.771e-11■■■■■ 29.8
SRSF7Q16629 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.254e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.044e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.254e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.344e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 TRAPPC12-210ENST00000441983 683 ntTSL 312.39□□□□□ -0.434e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.484e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 EPS15L1-215ENST00000602022 3082 ntTSL 1 (best)11.37□□□□□ -0.594e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.644e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.674e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 SHANK2-209ENST00000445654 522 ntTSL 310.84□□□□□ -0.674e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.684e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 TRAPPC12-206ENST00000417243 1047 ntTSL 510.37□□□□□ -0.754e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 TRAPPC12-218ENST00000479897 454 ntTSL 310.37□□□□□ -0.754e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 TRAPPC12-217ENST00000473348 491 ntTSL 510.33□□□□□ -0.764e-9■■■■■ 29.7
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