Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 BAIAP2-226ENST00000576364 542 ntTSL 58.64□□□□□ -1.032e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-213ENST00000573659 578 ntTSL 47.49□□□□□ -1.212e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-212ENST00000573017 574 ntTSL 47.11□□□□□ -1.272e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 BAIAP2-211ENST00000572918 626 ntTSL 45.68□□□□□ -1.52e-8■■■■■ 33.7
SRSF7Q16629 RNA5-8SP6-201ENST00000515896 152 ntBASIC8.08□□□□□ -1.122e-10■■■■■ 33.5
SRSF7Q16629 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-10■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.292e-10■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 TRIM24-206ENST00000497516 1515 ntTSL 511.79□□□□□ -0.522e-10■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 STRN3-203ENST00000366206 575 ntTSL 49.38□□□□□ -0.912e-10■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.022e-10■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 SP1-202ENST00000426431 7603 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.032e-13■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 UTRN-203ENST00000367526 3220 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.132e-10■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 STRN3-205ENST00000554991 417 ntTSL 56.67□□□□□ -1.342e-10■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 STRN3-208ENST00000556577 514 ntTSL 56.57□□□□□ -1.362e-10■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 CDK6-203ENST00000467166 779 ntTSL 25.76□□□□□ -1.492e-10■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 EIF4A2-201ENST00000323963 1919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.034e-13■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 EIF4A2-223ENST00000494445 629 ntTSL 26.92□□□□□ -1.34e-13■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 EIF4A2-203ENST00000426808 1751 ntTSL 1 (best)6.23□□□□□ -1.414e-13■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 EIF4A2-216ENST00000468362 1356 ntTSL 26.02□□□□□ -1.458e-9■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.514e-13■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 EIF4A2-207ENST00000443963 1729 ntTSL 1 (best)5.59□□□□□ -1.514e-13■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 EIF4A2-209ENST00000461021 575 ntTSL 25.15□□□□□ -1.598e-9■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 EIF4A2-202ENST00000425053 1977 ntTSL 55.09□□□□□ -1.594e-13■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 EIF4A2-222ENST00000492144 993 ntTSL 24.89□□□□□ -1.638e-9■■■■■ 33.1
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SRSF7Q16629 EIF4A2-226ENST00000497177 849 ntTSL 54.8□□□□□ -1.648e-9■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 EIF4A2-219ENST00000485101 5327 ntTSL 53.65□□□□□ -1.824e-13■■■■■ 33.1
SRSF7Q16629 ITIH2-202ENST00000379587 2848 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 32.5
SRSF7Q16629 ITIH2-201ENST00000358415 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 32.5
SRSF7Q16629 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.674e-10■■■■■ 32.4
SRSF7Q16629 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.761e-20■■■■■ 32.4
SRSF7Q16629 ZHX2-202ENST00000534247 873 ntTSL 35.03□□□□□ -1.64e-10■■■■■ 32.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-216ENST00000583503 641 ntTSL 313.68□□□□□ -0.225e-8■■■■■ 31.8
SRSF7Q16629 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.937e-10■■■■■ 31.8
SRSF7Q16629 MACROD1-208ENST00000545464 899 ntTSL 319.01■□□□□ 0.637e-10■■■■■ 31.8
SRSF7Q16629 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.526e-7■■■■■ 31.8
SRSF7Q16629 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.376e-7■■■■■ 31.8
SRSF7Q16629 SPPL2B-204ENST00000587851 586 ntTSL 317.08■□□□□ 0.326e-7■■■■■ 31.8
SRSF7Q16629 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.116e-7■■■■■ 31.8
SRSF7Q16629 SPPL2B-213ENST00000621568 1017 ntTSL 514.34□□□□□ -0.116e-7■■■■■ 31.8
SRSF7Q16629 SPPL2B-201ENST00000585725 583 ntTSL 313.2□□□□□ -0.36e-7■■■■■ 31.8
SRSF7Q16629 SPPL2B-203ENST00000586332 496 ntTSL 313.08□□□□□ -0.326e-7■■■■■ 31.8
SRSF7Q16629 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.346e-7■■■■■ 31.8
SRSF7Q16629 MACROD1-206ENST00000542359 459 ntTSL 311.9□□□□□ -0.57e-10■■■■■ 31.8
SRSF7Q16629 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.556e-7■■■■■ 31.8
SRSF7Q16629 AGRN-202ENST00000419249 861 ntTSL 314.75□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 31.4
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SRSF7Q16629 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 31.4
SRSF7Q16629 AGRN-203ENST00000461111 3385 ntTSL 1 (best)10.34□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 31.4
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SRSF7Q16629 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 31.2
SRSF7Q16629 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 31.2
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SRSF7Q16629 TMEM2-204ENST00000377057 2637 ntTSL 28.69□□□□□ -1.021e-9■■■■■ 31.1
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SRSF7Q16629 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.874e-23■■■■■ 30.6
SRSF7Q16629 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.374e-23■■■■■ 30.6
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SRSF7Q16629 QRICH2-203ENST00000524722 2253 ntTSL 1 (best)11.19□□□□□ -0.621e-10■■■■■ 30.6
SRSF7Q16629 QRICH2-201ENST00000262765 5357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.811e-10■■■■■ 30.6
SRSF7Q16629 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 30.3
SRSF7Q16629 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 30.3
SRSF7Q16629 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 30.3
SRSF7Q16629 VAV2-205ENST00000486113 523 ntTSL 210.02□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 30.3
SRSF7Q16629 GREB1-210ENST00000628795 438 ntTSL 54.11□□□□□ -1.757e-9■■■■■ 29.9
SRSF7Q16629 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.771e-11■■■■■ 29.8
SRSF7Q16629 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.254e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.044e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.254e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.344e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 TRAPPC12-210ENST00000441983 683 ntTSL 312.39□□□□□ -0.434e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.484e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 EPS15L1-215ENST00000602022 3082 ntTSL 1 (best)11.37□□□□□ -0.594e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.644e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.674e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 SHANK2-209ENST00000445654 522 ntTSL 310.84□□□□□ -0.674e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.684e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 TRAPPC12-206ENST00000417243 1047 ntTSL 510.37□□□□□ -0.754e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 TRAPPC12-218ENST00000479897 454 ntTSL 310.37□□□□□ -0.754e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 TRAPPC12-217ENST00000473348 491 ntTSL 510.33□□□□□ -0.764e-9■■■■■ 29.7
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