Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF9Q16594 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF9Q16594 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF9Q16594 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF9Q16594 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF9Q16594 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF9Q16594 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF9Q16594 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF9Q16594 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF9Q16594 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF9Q16594 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF9Q16594 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF9Q16594 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF9Q16594 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF9Q16594 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF9Q16594 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF9Q16594 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF9Q16594 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF9Q16594 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF9Q16594 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF9Q16594 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF9Q16594 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF9Q16594 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF9Q16594 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF9Q16594 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF9Q16594 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF9Q16594 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF9Q16594 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF9Q16594 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF9Q16594 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF9Q16594 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF9Q16594 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF9Q16594 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF9Q16594 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF9Q16594 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF9Q16594 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF9Q16594 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF9Q16594 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF9Q16594 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF9Q16594 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF9Q16594 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF9Q16594 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF9Q16594 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF9Q16594 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF9Q16594 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF9Q16594 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF9Q16594 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF9Q16594 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF9Q16594 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF9Q16594 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF9Q16594 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF9Q16594 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF9Q16594 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF9Q16594 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF9Q16594 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF9Q16594 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF9Q16594 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF9Q16594 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF9Q16594 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF9Q16594 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF9Q16594 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF9Q16594 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF9Q16594 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF9Q16594 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF9Q16594 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF9Q16594 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF9Q16594 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF9Q16594 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF9Q16594 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF9Q16594 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF9Q16594 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF9Q16594 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF9Q16594 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF9Q16594 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF9Q16594 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF9Q16594 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF9Q16594 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF9Q16594 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF9Q16594 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF9Q16594 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF9Q16594 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF9Q16594 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF9Q16594 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF9Q16594 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF9Q16594 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF9Q16594 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF9Q16594 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF9Q16594 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF9Q16594 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF9Q16594 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF9Q16594 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF9Q16594 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF9Q16594 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF9Q16594 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF9Q16594 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF9Q16594 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF9Q16594 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF9Q16594 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF9Q16594 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF9Q16594 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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