Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAPC1Q16533 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAPC1Q16533 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAPC1Q16533 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAPC1Q16533 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAPC1Q16533 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAPC1Q16533 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAPC1Q16533 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAPC1Q16533 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAPC1Q16533 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAPC1Q16533 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAPC1Q16533 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAPC1Q16533 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAPC1Q16533 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAPC1Q16533 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAPC1Q16533 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNAPC1Q16533 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAPC1Q16533 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAPC1Q16533 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAPC1Q16533 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAPC1Q16533 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAPC1Q16533 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAPC1Q16533 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAPC1Q16533 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAPC1Q16533 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAPC1Q16533 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC1Q16533 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAPC1Q16533 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAPC1Q16533 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAPC1Q16533 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAPC1Q16533 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAPC1Q16533 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAPC1Q16533 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAPC1Q16533 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAPC1Q16533 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAPC1Q16533 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAPC1Q16533 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAPC1Q16533 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAPC1Q16533 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAPC1Q16533 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNAPC1Q16533 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNAPC1Q16533 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNAPC1Q16533 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNAPC1Q16533 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAPC1Q16533 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAPC1Q16533 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAPC1Q16533 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAPC1Q16533 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAPC1Q16533 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAPC1Q16533 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAPC1Q16533 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAPC1Q16533 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAPC1Q16533 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAPC1Q16533 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAPC1Q16533 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAPC1Q16533 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAPC1Q16533 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAPC1Q16533 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAPC1Q16533 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAPC1Q16533 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAPC1Q16533 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAPC1Q16533 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAPC1Q16533 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAPC1Q16533 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAPC1Q16533 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAPC1Q16533 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAPC1Q16533 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAPC1Q16533 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAPC1Q16533 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAPC1Q16533 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAPC1Q16533 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAPC1Q16533 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAPC1Q16533 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAPC1Q16533 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAPC1Q16533 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAPC1Q16533 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAPC1Q16533 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAPC1Q16533 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAPC1Q16533 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAPC1Q16533 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAPC1Q16533 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAPC1Q16533 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAPC1Q16533 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAPC1Q16533 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAPC1Q16533 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAPC1Q16533 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAPC1Q16533 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAPC1Q16533 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNAPC1Q16533 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAPC1Q16533 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAPC1Q16533 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAPC1Q16533 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAPC1Q16533 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAPC1Q16533 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAPC1Q16533 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAPC1Q16533 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNAPC1Q16533 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNAPC1Q16533 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAPC1Q16533 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAPC1Q16533 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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