Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMAD1Q15797 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMAD1Q15797 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMAD1Q15797 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMAD1Q15797 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMAD1Q15797 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMAD1Q15797 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMAD1Q15797 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMAD1Q15797 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMAD1Q15797 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMAD1Q15797 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMAD1Q15797 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMAD1Q15797 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMAD1Q15797 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMAD1Q15797 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMAD1Q15797 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMAD1Q15797 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMAD1Q15797 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMAD1Q15797 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMAD1Q15797 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMAD1Q15797 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMAD1Q15797 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMAD1Q15797 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMAD1Q15797 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SMAD1Q15797 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMAD1Q15797 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMAD1Q15797 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMAD1Q15797 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMAD1Q15797 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMAD1Q15797 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMAD1Q15797 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMAD1Q15797 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SMAD1Q15797 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMAD1Q15797 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SMAD1Q15797 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMAD1Q15797 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMAD1Q15797 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMAD1Q15797 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMAD1Q15797 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMAD1Q15797 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMAD1Q15797 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMAD1Q15797 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMAD1Q15797 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMAD1Q15797 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMAD1Q15797 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMAD1Q15797 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMAD1Q15797 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMAD1Q15797 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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