Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRRQ15256 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRRQ15256 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRRQ15256 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRRQ15256 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRRQ15256 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRRQ15256 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRRQ15256 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRRQ15256 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRRQ15256 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRRQ15256 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRRQ15256 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRRQ15256 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRRQ15256 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRRQ15256 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRRQ15256 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRRQ15256 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRRQ15256 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRRQ15256 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRRQ15256 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRRQ15256 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRRQ15256 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRRQ15256 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRRQ15256 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRRQ15256 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRRQ15256 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRRQ15256 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRRQ15256 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRRQ15256 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRRQ15256 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRRQ15256 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PTPRRQ15256 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRRQ15256 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRRQ15256 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRRQ15256 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRRQ15256 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRRQ15256 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRRQ15256 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRRQ15256 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRRQ15256 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRRQ15256 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRRQ15256 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRRQ15256 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRRQ15256 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRRQ15256 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRRQ15256 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRRQ15256 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRRQ15256 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRRQ15256 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRRQ15256 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRRQ15256 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRRQ15256 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRRQ15256 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRRQ15256 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRRQ15256 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRRQ15256 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRRQ15256 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRRQ15256 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRRQ15256 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRRQ15256 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRRQ15256 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRRQ15256 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
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PTPRRQ15256 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRRQ15256 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRRQ15256 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRRQ15256 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRRQ15256 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRRQ15256 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRRQ15256 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRRQ15256 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
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PTPRRQ15256 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
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PTPRRQ15256 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRRQ15256 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRRQ15256 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRRQ15256 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRRQ15256 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRRQ15256 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRRQ15256 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRRQ15256 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRRQ15256 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRRQ15256 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRRQ15256 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRRQ15256 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRRQ15256 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRRQ15256 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRRQ15256 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRRQ15256 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRRQ15256 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRRQ15256 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRRQ15256 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRRQ15256 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRRQ15256 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRRQ15256 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRRQ15256 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRRQ15256 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
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