Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RAB3GAP1Q15042 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RAB3GAP1Q15042 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RAB3GAP1Q15042 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAB3GAP1Q15042 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RAB3GAP1Q15042 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAB3GAP1Q15042 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAB3GAP1Q15042 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RAB3GAP1Q15042 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RAB3GAP1Q15042 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RAB3GAP1Q15042 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RAB3GAP1Q15042 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RAB3GAP1Q15042 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RAB3GAP1Q15042 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RAB3GAP1Q15042 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RAB3GAP1Q15042 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RAB3GAP1Q15042 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RAB3GAP1Q15042 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RAB3GAP1Q15042 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RAB3GAP1Q15042 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RAB3GAP1Q15042 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RAB3GAP1Q15042 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RAB3GAP1Q15042 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RAB3GAP1Q15042 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RAB3GAP1Q15042 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RAB3GAP1Q15042 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RAB3GAP1Q15042 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RAB3GAP1Q15042 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RAB3GAP1Q15042 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RAB3GAP1Q15042 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
RAB3GAP1Q15042 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RAB3GAP1Q15042 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAB3GAP1Q15042 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAB3GAP1Q15042 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAB3GAP1Q15042 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAB3GAP1Q15042 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAB3GAP1Q15042 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RAB3GAP1Q15042 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAB3GAP1Q15042 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAB3GAP1Q15042 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAB3GAP1Q15042 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RAB3GAP1Q15042 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAB3GAP1Q15042 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAB3GAP1Q15042 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAB3GAP1Q15042 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RAB3GAP1Q15042 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAB3GAP1Q15042 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RAB3GAP1Q15042 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RAB3GAP1Q15042 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAB3GAP1Q15042 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAB3GAP1Q15042 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAB3GAP1Q15042 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAB3GAP1Q15042 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAB3GAP1Q15042 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RAB3GAP1Q15042 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
RAB3GAP1Q15042 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RAB3GAP1Q15042 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RAB3GAP1Q15042 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RAB3GAP1Q15042 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAB3GAP1Q15042 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAB3GAP1Q15042 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAB3GAP1Q15042 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RAB3GAP1Q15042 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RAB3GAP1Q15042 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
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