Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NBR1Q14596 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NBR1Q14596 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NBR1Q14596 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NBR1Q14596 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NBR1Q14596 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NBR1Q14596 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NBR1Q14596 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NBR1Q14596 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NBR1Q14596 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NBR1Q14596 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NBR1Q14596 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NBR1Q14596 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NBR1Q14596 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NBR1Q14596 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NBR1Q14596 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NBR1Q14596 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NBR1Q14596 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.77■■■■□ 3
NBR1Q14596 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NBR1Q14596 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NBR1Q14596 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NBR1Q14596 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NBR1Q14596 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NBR1Q14596 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NBR1Q14596 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NBR1Q14596 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NBR1Q14596 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NBR1Q14596 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NBR1Q14596 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NBR1Q14596 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NBR1Q14596 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NBR1Q14596 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NBR1Q14596 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NBR1Q14596 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NBR1Q14596 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NBR1Q14596 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NBR1Q14596 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NBR1Q14596 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NBR1Q14596 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NBR1Q14596 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NBR1Q14596 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NBR1Q14596 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NBR1Q14596 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NBR1Q14596 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NBR1Q14596 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NBR1Q14596 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NBR1Q14596 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NBR1Q14596 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NBR1Q14596 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NBR1Q14596 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NBR1Q14596 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NBR1Q14596 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NBR1Q14596 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NBR1Q14596 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NBR1Q14596 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NBR1Q14596 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NBR1Q14596 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NBR1Q14596 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NBR1Q14596 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NBR1Q14596 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NBR1Q14596 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NBR1Q14596 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
NBR1Q14596 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NBR1Q14596 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NBR1Q14596 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NBR1Q14596 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NBR1Q14596 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NBR1Q14596 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NBR1Q14596 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NBR1Q14596 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NBR1Q14596 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NBR1Q14596 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NBR1Q14596 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NBR1Q14596 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NBR1Q14596 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NBR1Q14596 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NBR1Q14596 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NBR1Q14596 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NBR1Q14596 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NBR1Q14596 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NBR1Q14596 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NBR1Q14596 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NBR1Q14596 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NBR1Q14596 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NBR1Q14596 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NBR1Q14596 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NBR1Q14596 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NBR1Q14596 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NBR1Q14596 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NBR1Q14596 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NBR1Q14596 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NBR1Q14596 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NBR1Q14596 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NBR1Q14596 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NBR1Q14596 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NBR1Q14596 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NBR1Q14596 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NBR1Q14596 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NBR1Q14596 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NBR1Q14596 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms