Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1DQ13901 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1DQ13901 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1DQ13901 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1DQ13901 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1DQ13901 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1DQ13901 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1DQ13901 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C1DQ13901 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1DQ13901 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1DQ13901 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1DQ13901 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1DQ13901 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1DQ13901 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1DQ13901 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1DQ13901 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1DQ13901 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1DQ13901 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1DQ13901 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1DQ13901 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
C1DQ13901 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1DQ13901 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1DQ13901 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1DQ13901 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1DQ13901 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1DQ13901 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1DQ13901 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1DQ13901 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1DQ13901 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1DQ13901 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1DQ13901 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1DQ13901 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1DQ13901 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1DQ13901 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1DQ13901 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1DQ13901 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C1DQ13901 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C1DQ13901 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1DQ13901 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1DQ13901 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1DQ13901 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
C1DQ13901 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1DQ13901 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1DQ13901 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1DQ13901 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1DQ13901 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1DQ13901 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1DQ13901 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1DQ13901 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1DQ13901 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1DQ13901 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1DQ13901 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1DQ13901 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1DQ13901 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1DQ13901 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1DQ13901 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1DQ13901 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1DQ13901 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1DQ13901 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1DQ13901 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1DQ13901 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1DQ13901 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1DQ13901 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1DQ13901 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1DQ13901 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C1DQ13901 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
C1DQ13901 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1DQ13901 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1DQ13901 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1DQ13901 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C1DQ13901 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1DQ13901 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1DQ13901 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1DQ13901 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1DQ13901 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1DQ13901 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1DQ13901 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1DQ13901 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1DQ13901 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1DQ13901 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1DQ13901 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1DQ13901 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1DQ13901 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1DQ13901 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1DQ13901 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1DQ13901 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1DQ13901 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1DQ13901 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1DQ13901 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1DQ13901 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1DQ13901 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1DQ13901 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1DQ13901 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1DQ13901 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1DQ13901 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1DQ13901 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1DQ13901 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C1DQ13901 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C1DQ13901 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1DQ13901 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
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