Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2H2Q13888 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2H2Q13888 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2H2Q13888 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2H2Q13888 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2H2Q13888 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2H2Q13888 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2H2Q13888 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2H2Q13888 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2H2Q13888 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2H2Q13888 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2H2Q13888 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2H2Q13888 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2H2Q13888 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2H2Q13888 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2H2Q13888 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2H2Q13888 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2H2Q13888 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2H2Q13888 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GTF2H2Q13888 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2H2Q13888 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2H2Q13888 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2H2Q13888 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2H2Q13888 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2H2Q13888 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GTF2H2Q13888 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2H2Q13888 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2H2Q13888 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2H2Q13888 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2H2Q13888 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF2H2Q13888 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF2H2Q13888 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2H2Q13888 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2H2Q13888 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2H2Q13888 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2H2Q13888 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2H2Q13888 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2H2Q13888 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2H2Q13888 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2H2Q13888 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2H2Q13888 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2H2Q13888 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2H2Q13888 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2H2Q13888 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2H2Q13888 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2H2Q13888 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2H2Q13888 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2H2Q13888 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2H2Q13888 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2H2Q13888 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2H2Q13888 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2H2Q13888 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2H2Q13888 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2H2Q13888 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2H2Q13888 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2H2Q13888 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2H2Q13888 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2H2Q13888 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2H2Q13888 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2H2Q13888 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2H2Q13888 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2H2Q13888 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2H2Q13888 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2H2Q13888 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2H2Q13888 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2H2Q13888 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2H2Q13888 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GTF2H2Q13888 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GTF2H2Q13888 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2H2Q13888 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2H2Q13888 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2H2Q13888 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2H2Q13888 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2H2Q13888 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2H2Q13888 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2H2Q13888 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2H2Q13888 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2H2Q13888 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2H2Q13888 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2H2Q13888 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2H2Q13888 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2H2Q13888 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2H2Q13888 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2H2Q13888 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2H2Q13888 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2H2Q13888 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2H2Q13888 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2H2Q13888 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2H2Q13888 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2H2Q13888 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2H2Q13888 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2H2Q13888 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2H2Q13888 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2H2Q13888 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2H2Q13888 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2H2Q13888 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2H2Q13888 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2H2Q13888 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2H2Q13888 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2H2Q13888 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms