Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
PKD2Q13563 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
PKD2Q13563 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
PKD2Q13563 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
PKD2Q13563 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
PKD2Q13563 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
PKD2Q13563 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
PKD2Q13563 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
PKD2Q13563 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.75■■■■■ 4.27
PKD2Q13563 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
PKD2Q13563 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
PKD2Q13563 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
PKD2Q13563 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
PKD2Q13563 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
PKD2Q13563 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
PKD2Q13563 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
PKD2Q13563 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
PKD2Q13563 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
PKD2Q13563 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
PKD2Q13563 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
PKD2Q13563 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
PKD2Q13563 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
PKD2Q13563 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
PKD2Q13563 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
PKD2Q13563 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
PKD2Q13563 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
PKD2Q13563 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
PKD2Q13563 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PKD2Q13563 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
PKD2Q13563 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
PKD2Q13563 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
PKD2Q13563 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
PKD2Q13563 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
PKD2Q13563 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
PKD2Q13563 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
PKD2Q13563 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
PKD2Q13563 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC41.53■■■■■ 4.24
PKD2Q13563 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
PKD2Q13563 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
PKD2Q13563 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
PKD2Q13563 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
PKD2Q13563 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
PKD2Q13563 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
PKD2Q13563 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
PKD2Q13563 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
PKD2Q13563 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
PKD2Q13563 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
PKD2Q13563 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
PKD2Q13563 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.35■■■■■ 4.21
PKD2Q13563 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
PKD2Q13563 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.21
PKD2Q13563 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
PKD2Q13563 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
PKD2Q13563 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
PKD2Q13563 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
PKD2Q13563 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
PKD2Q13563 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
PKD2Q13563 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
PKD2Q13563 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
PKD2Q13563 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
PKD2Q13563 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PKD2Q13563 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
PKD2Q13563 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PKD2Q13563 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
PKD2Q13563 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
PKD2Q13563 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
PKD2Q13563 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
PKD2Q13563 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PKD2Q13563 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
PKD2Q13563 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
PKD2Q13563 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
PKD2Q13563 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PKD2Q13563 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
PKD2Q13563 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
PKD2Q13563 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
PKD2Q13563 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
PKD2Q13563 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
PKD2Q13563 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
PKD2Q13563 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
PKD2Q13563 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
PKD2Q13563 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
PKD2Q13563 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PKD2Q13563 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
PKD2Q13563 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
PKD2Q13563 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40.93■■■■■ 4.14
PKD2Q13563 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
PKD2Q13563 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
PKD2Q13563 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
PKD2Q13563 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
PKD2Q13563 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
PKD2Q13563 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
PKD2Q13563 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
PKD2Q13563 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
PKD2Q13563 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
PKD2Q13563 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
PKD2Q13563 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PKD2Q13563 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
PKD2Q13563 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
PKD2Q13563 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.79■■■■■ 4.12
PKD2Q13563 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
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