Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PMS2P3Q13401 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PMS2P3Q13401 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PMS2P3Q13401 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PMS2P3Q13401 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PMS2P3Q13401 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PMS2P3Q13401 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PMS2P3Q13401 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PMS2P3Q13401 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PMS2P3Q13401 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PMS2P3Q13401 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PMS2P3Q13401 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PMS2P3Q13401 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PMS2P3Q13401 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PMS2P3Q13401 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PMS2P3Q13401 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PMS2P3Q13401 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PMS2P3Q13401 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PMS2P3Q13401 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PMS2P3Q13401 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PMS2P3Q13401 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PMS2P3Q13401 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PMS2P3Q13401 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PMS2P3Q13401 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMS2P3Q13401 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMS2P3Q13401 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMS2P3Q13401 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMS2P3Q13401 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMS2P3Q13401 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMS2P3Q13401 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMS2P3Q13401 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PMS2P3Q13401 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PMS2P3Q13401 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PMS2P3Q13401 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PMS2P3Q13401 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PMS2P3Q13401 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMS2P3Q13401 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMS2P3Q13401 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMS2P3Q13401 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMS2P3Q13401 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMS2P3Q13401 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMS2P3Q13401 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMS2P3Q13401 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMS2P3Q13401 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMS2P3Q13401 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMS2P3Q13401 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMS2P3Q13401 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMS2P3Q13401 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PMS2P3Q13401 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PMS2P3Q13401 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS2P3Q13401 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS2P3Q13401 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS2P3Q13401 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMS2P3Q13401 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMS2P3Q13401 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMS2P3Q13401 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMS2P3Q13401 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMS2P3Q13401 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMS2P3Q13401 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMS2P3Q13401 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PMS2P3Q13401 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMS2P3Q13401 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMS2P3Q13401 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMS2P3Q13401 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMS2P3Q13401 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMS2P3Q13401 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMS2P3Q13401 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMS2P3Q13401 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMS2P3Q13401 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS2P3Q13401 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS2P3Q13401 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMS2P3Q13401 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMS2P3Q13401 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PMS2P3Q13401 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMS2P3Q13401 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMS2P3Q13401 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMS2P3Q13401 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMS2P3Q13401 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMS2P3Q13401 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMS2P3Q13401 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMS2P3Q13401 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMS2P3Q13401 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMS2P3Q13401 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMS2P3Q13401 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMS2P3Q13401 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMS2P3Q13401 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMS2P3Q13401 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PMS2P3Q13401 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PMS2P3Q13401 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PMS2P3Q13401 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PMS2P3Q13401 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PMS2P3Q13401 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PMS2P3Q13401 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMS2P3Q13401 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMS2P3Q13401 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMS2P3Q13401 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMS2P3Q13401 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMS2P3Q13401 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMS2P3Q13401 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMS2P3Q13401 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
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