Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NR1H3Q13133 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NR1H3Q13133 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NR1H3Q13133 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NR1H3Q13133 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NR1H3Q13133 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NR1H3Q13133 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NR1H3Q13133 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NR1H3Q13133 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NR1H3Q13133 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NR1H3Q13133 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NR1H3Q13133 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NR1H3Q13133 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NR1H3Q13133 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NR1H3Q13133 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NR1H3Q13133 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NR1H3Q13133 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NR1H3Q13133 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NR1H3Q13133 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NR1H3Q13133 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NR1H3Q13133 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NR1H3Q13133 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NR1H3Q13133 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NR1H3Q13133 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NR1H3Q13133 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NR1H3Q13133 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NR1H3Q13133 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NR1H3Q13133 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NR1H3Q13133 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NR1H3Q13133 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NR1H3Q13133 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NR1H3Q13133 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NR1H3Q13133 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NR1H3Q13133 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NR1H3Q13133 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NR1H3Q13133 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NR1H3Q13133 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NR1H3Q13133 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NR1H3Q13133 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NR1H3Q13133 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NR1H3Q13133 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NR1H3Q13133 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NR1H3Q13133 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NR1H3Q13133 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NR1H3Q13133 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NR1H3Q13133 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NR1H3Q13133 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NR1H3Q13133 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NR1H3Q13133 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NR1H3Q13133 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NR1H3Q13133 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NR1H3Q13133 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NR1H3Q13133 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NR1H3Q13133 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NR1H3Q13133 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NR1H3Q13133 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NR1H3Q13133 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NR1H3Q13133 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NR1H3Q13133 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NR1H3Q13133 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NR1H3Q13133 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NR1H3Q13133 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NR1H3Q13133 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NR1H3Q13133 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NR1H3Q13133 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NR1H3Q13133 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NR1H3Q13133 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NR1H3Q13133 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NR1H3Q13133 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NR1H3Q13133 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NR1H3Q13133 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NR1H3Q13133 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NR1H3Q13133 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NR1H3Q13133 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NR1H3Q13133 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NR1H3Q13133 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NR1H3Q13133 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NR1H3Q13133 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NR1H3Q13133 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NR1H3Q13133 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NR1H3Q13133 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NR1H3Q13133 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NR1H3Q13133 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NR1H3Q13133 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NR1H3Q13133 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NR1H3Q13133 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NR1H3Q13133 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NR1H3Q13133 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NR1H3Q13133 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NR1H3Q13133 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NR1H3Q13133 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NR1H3Q13133 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NR1H3Q13133 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NR1H3Q13133 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NR1H3Q13133 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NR1H3Q13133 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NR1H3Q13133 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NR1H3Q13133 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NR1H3Q13133 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NR1H3Q13133 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
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