Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FOXD4Q12950 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4Q12950 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4Q12950 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4Q12950 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4Q12950 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4Q12950 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4Q12950 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4Q12950 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4Q12950 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4Q12950 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4Q12950 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4Q12950 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4Q12950 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD4Q12950 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4Q12950 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4Q12950 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4Q12950 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4Q12950 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD4Q12950 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD4Q12950 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4Q12950 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4Q12950 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4Q12950 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4Q12950 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4Q12950 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD4Q12950 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXD4Q12950 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXD4Q12950 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXD4Q12950 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4Q12950 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXD4Q12950 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4Q12950 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4Q12950 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4Q12950 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4Q12950 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4Q12950 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4Q12950 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXD4Q12950 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4Q12950 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD4Q12950 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4Q12950 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4Q12950 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD4Q12950 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXD4Q12950 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXD4Q12950 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4Q12950 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD4Q12950 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD4Q12950 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4Q12950 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4Q12950 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4Q12950 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4Q12950 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4Q12950 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4Q12950 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD4Q12950 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD4Q12950 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD4Q12950 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXD4Q12950 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXD4Q12950 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXD4Q12950 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4Q12950 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4Q12950 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4Q12950 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4Q12950 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4Q12950 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4Q12950 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4Q12950 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4Q12950 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4Q12950 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4Q12950 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4Q12950 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4Q12950 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXD4Q12950 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXD4Q12950 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4Q12950 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4Q12950 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4Q12950 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4Q12950 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4Q12950 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4Q12950 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4Q12950 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4Q12950 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4Q12950 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD4Q12950 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD4Q12950 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4Q12950 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4Q12950 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4Q12950 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4Q12950 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4Q12950 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4Q12950 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4Q12950 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4Q12950 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4Q12950 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4Q12950 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4Q12950 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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