Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC15Q0P6D6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC15Q0P6D6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC15Q0P6D6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC15Q0P6D6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC15Q0P6D6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC15Q0P6D6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC15Q0P6D6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC15Q0P6D6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC15Q0P6D6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC15Q0P6D6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC15Q0P6D6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC15Q0P6D6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC15Q0P6D6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC15Q0P6D6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC15Q0P6D6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC15Q0P6D6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC15Q0P6D6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC15Q0P6D6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC15Q0P6D6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC15Q0P6D6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC15Q0P6D6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC15Q0P6D6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC15Q0P6D6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC15Q0P6D6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC15Q0P6D6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC15Q0P6D6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC15Q0P6D6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC15Q0P6D6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC15Q0P6D6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC15Q0P6D6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC15Q0P6D6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC15Q0P6D6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC15Q0P6D6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC15Q0P6D6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC15Q0P6D6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC15Q0P6D6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC15Q0P6D6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC15Q0P6D6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC15Q0P6D6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC15Q0P6D6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC15Q0P6D6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC15Q0P6D6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC15Q0P6D6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC15Q0P6D6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC15Q0P6D6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC15Q0P6D6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC15Q0P6D6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC15Q0P6D6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC15Q0P6D6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC15Q0P6D6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC15Q0P6D6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC15Q0P6D6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC15Q0P6D6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC15Q0P6D6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC15Q0P6D6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC15Q0P6D6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC15Q0P6D6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC15Q0P6D6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC15Q0P6D6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC15Q0P6D6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC15Q0P6D6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC15Q0P6D6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC15Q0P6D6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC15Q0P6D6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC15Q0P6D6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC15Q0P6D6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC15Q0P6D6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC15Q0P6D6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC15Q0P6D6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC15Q0P6D6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC15Q0P6D6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC15Q0P6D6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC15Q0P6D6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC15Q0P6D6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC15Q0P6D6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC15Q0P6D6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC15Q0P6D6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC15Q0P6D6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC15Q0P6D6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC15Q0P6D6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC15Q0P6D6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC15Q0P6D6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC15Q0P6D6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC15Q0P6D6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC15Q0P6D6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC15Q0P6D6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC15Q0P6D6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC15Q0P6D6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC15Q0P6D6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC15Q0P6D6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC15Q0P6D6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC15Q0P6D6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC15Q0P6D6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC15Q0P6D6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC15Q0P6D6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC15Q0P6D6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC15Q0P6D6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC15Q0P6D6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC15Q0P6D6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms