Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPPLY1Q0D2K3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPPLY1Q0D2K3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPPLY1Q0D2K3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPPLY1Q0D2K3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPPLY1Q0D2K3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPPLY1Q0D2K3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPPLY1Q0D2K3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPPLY1Q0D2K3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPPLY1Q0D2K3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPPLY1Q0D2K3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPPLY1Q0D2K3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPPLY1Q0D2K3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPPLY1Q0D2K3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPPLY1Q0D2K3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPPLY1Q0D2K3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPPLY1Q0D2K3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPPLY1Q0D2K3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPPLY1Q0D2K3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPPLY1Q0D2K3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPPLY1Q0D2K3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIPPLY1Q0D2K3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIPPLY1Q0D2K3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPPLY1Q0D2K3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPPLY1Q0D2K3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPPLY1Q0D2K3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPPLY1Q0D2K3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPPLY1Q0D2K3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPPLY1Q0D2K3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPPLY1Q0D2K3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPPLY1Q0D2K3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPPLY1Q0D2K3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPPLY1Q0D2K3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPPLY1Q0D2K3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPPLY1Q0D2K3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPPLY1Q0D2K3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPPLY1Q0D2K3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIPPLY1Q0D2K3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIPPLY1Q0D2K3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIPPLY1Q0D2K3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPPLY1Q0D2K3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPPLY1Q0D2K3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPPLY1Q0D2K3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPPLY1Q0D2K3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPPLY1Q0D2K3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPPLY1Q0D2K3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPPLY1Q0D2K3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPPLY1Q0D2K3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPPLY1Q0D2K3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPPLY1Q0D2K3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPPLY1Q0D2K3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPPLY1Q0D2K3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPPLY1Q0D2K3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPPLY1Q0D2K3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPPLY1Q0D2K3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPPLY1Q0D2K3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPPLY1Q0D2K3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPPLY1Q0D2K3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIPPLY1Q0D2K3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIPPLY1Q0D2K3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIPPLY1Q0D2K3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIPPLY1Q0D2K3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIPPLY1Q0D2K3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIPPLY1Q0D2K3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIPPLY1Q0D2K3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIPPLY1Q0D2K3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIPPLY1Q0D2K3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIPPLY1Q0D2K3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIPPLY1Q0D2K3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIPPLY1Q0D2K3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIPPLY1Q0D2K3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIPPLY1Q0D2K3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIPPLY1Q0D2K3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIPPLY1Q0D2K3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RIPPLY1Q0D2K3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIPPLY1Q0D2K3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPPLY1Q0D2K3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPPLY1Q0D2K3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIPPLY1Q0D2K3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RIPPLY1Q0D2K3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIPPLY1Q0D2K3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIPPLY1Q0D2K3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIPPLY1Q0D2K3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIPPLY1Q0D2K3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIPPLY1Q0D2K3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms