Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K2

KLHL30, Kelch-like protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL30Q0D2K2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KLHL30Q0D2K2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KLHL30Q0D2K2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KLHL30Q0D2K2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KLHL30Q0D2K2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KLHL30Q0D2K2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KLHL30Q0D2K2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KLHL30Q0D2K2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KLHL30Q0D2K2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KLHL30Q0D2K2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KLHL30Q0D2K2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KLHL30Q0D2K2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KLHL30Q0D2K2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KLHL30Q0D2K2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KLHL30Q0D2K2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KLHL30Q0D2K2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KLHL30Q0D2K2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KLHL30Q0D2K2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KLHL30Q0D2K2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KLHL30Q0D2K2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KLHL30Q0D2K2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KLHL30Q0D2K2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KLHL30Q0D2K2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KLHL30Q0D2K2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KLHL30Q0D2K2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KLHL30Q0D2K2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KLHL30Q0D2K2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KLHL30Q0D2K2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KLHL30Q0D2K2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KLHL30Q0D2K2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KLHL30Q0D2K2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KLHL30Q0D2K2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KLHL30Q0D2K2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KLHL30Q0D2K2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KLHL30Q0D2K2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KLHL30Q0D2K2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KLHL30Q0D2K2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KLHL30Q0D2K2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KLHL30Q0D2K2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
KLHL30Q0D2K2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KLHL30Q0D2K2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KLHL30Q0D2K2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KLHL30Q0D2K2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KLHL30Q0D2K2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KLHL30Q0D2K2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KLHL30Q0D2K2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KLHL30Q0D2K2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KLHL30Q0D2K2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KLHL30Q0D2K2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KLHL30Q0D2K2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KLHL30Q0D2K2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KLHL30Q0D2K2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLHL30Q0D2K2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
KLHL30Q0D2K2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLHL30Q0D2K2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KLHL30Q0D2K2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KLHL30Q0D2K2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KLHL30Q0D2K2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHL30Q0D2K2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KLHL30Q0D2K2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLHL30Q0D2K2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLHL30Q0D2K2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLHL30Q0D2K2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLHL30Q0D2K2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KLHL30Q0D2K2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KLHL30Q0D2K2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KLHL30Q0D2K2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KLHL30Q0D2K2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KLHL30Q0D2K2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KLHL30Q0D2K2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KLHL30Q0D2K2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KLHL30Q0D2K2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLHL30Q0D2K2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLHL30Q0D2K2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLHL30Q0D2K2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLHL30Q0D2K2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLHL30Q0D2K2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLHL30Q0D2K2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLHL30Q0D2K2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KLHL30Q0D2K2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KLHL30Q0D2K2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KLHL30Q0D2K2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KLHL30Q0D2K2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KLHL30Q0D2K2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KLHL30Q0D2K2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KLHL30Q0D2K2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KLHL30Q0D2K2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KLHL30Q0D2K2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KLHL30Q0D2K2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KLHL30Q0D2K2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KLHL30Q0D2K2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KLHL30Q0D2K2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KLHL30Q0D2K2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
KLHL30Q0D2K2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KLHL30Q0D2K2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KLHL30Q0D2K2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KLHL30Q0D2K2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KLHL30Q0D2K2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KLHL30Q0D2K2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
KLHL30Q0D2K2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms