Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NCBP1Q09161 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCBP1Q09161 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCBP1Q09161 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NCBP1Q09161 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NCBP1Q09161 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NCBP1Q09161 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCBP1Q09161 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCBP1Q09161 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCBP1Q09161 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCBP1Q09161 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCBP1Q09161 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NCBP1Q09161 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCBP1Q09161 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCBP1Q09161 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NCBP1Q09161 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NCBP1Q09161 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NCBP1Q09161 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NCBP1Q09161 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NCBP1Q09161 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NCBP1Q09161 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NCBP1Q09161 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NCBP1Q09161 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NCBP1Q09161 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
NCBP1Q09161 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
NCBP1Q09161 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NCBP1Q09161 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NCBP1Q09161 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NCBP1Q09161 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NCBP1Q09161 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NCBP1Q09161 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NCBP1Q09161 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NCBP1Q09161 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NCBP1Q09161 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NCBP1Q09161 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NCBP1Q09161 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NCBP1Q09161 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NCBP1Q09161 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NCBP1Q09161 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NCBP1Q09161 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NCBP1Q09161 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NCBP1Q09161 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NCBP1Q09161 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NCBP1Q09161 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NCBP1Q09161 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NCBP1Q09161 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NCBP1Q09161 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NCBP1Q09161 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCBP1Q09161 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NCBP1Q09161 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NCBP1Q09161 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NCBP1Q09161 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NCBP1Q09161 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NCBP1Q09161 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NCBP1Q09161 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NCBP1Q09161 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
NCBP1Q09161 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NCBP1Q09161 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NCBP1Q09161 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NCBP1Q09161 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NCBP1Q09161 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NCBP1Q09161 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NCBP1Q09161 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NCBP1Q09161 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NCBP1Q09161 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NCBP1Q09161 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NCBP1Q09161 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NCBP1Q09161 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NCBP1Q09161 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NCBP1Q09161 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
NCBP1Q09161 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NCBP1Q09161 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NCBP1Q09161 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NCBP1Q09161 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NCBP1Q09161 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NCBP1Q09161 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NCBP1Q09161 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NCBP1Q09161 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NCBP1Q09161 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NCBP1Q09161 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NCBP1Q09161 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NCBP1Q09161 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCBP1Q09161 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCBP1Q09161 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCBP1Q09161 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCBP1Q09161 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCBP1Q09161 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NCBP1Q09161 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NCBP1Q09161 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NCBP1Q09161 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NCBP1Q09161 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NCBP1Q09161 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCBP1Q09161 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCBP1Q09161 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCBP1Q09161 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NCBP1Q09161 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NCBP1Q09161 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCBP1Q09161 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCBP1Q09161 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCBP1Q09161 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms