Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GABPB1Q06547 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GABPB1Q06547 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GABPB1Q06547 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GABPB1Q06547 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GABPB1Q06547 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GABPB1Q06547 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GABPB1Q06547 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GABPB1Q06547 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GABPB1Q06547 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GABPB1Q06547 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GABPB1Q06547 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GABPB1Q06547 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GABPB1Q06547 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GABPB1Q06547 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GABPB1Q06547 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GABPB1Q06547 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GABPB1Q06547 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GABPB1Q06547 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GABPB1Q06547 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GABPB1Q06547 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GABPB1Q06547 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GABPB1Q06547 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GABPB1Q06547 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GABPB1Q06547 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GABPB1Q06547 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GABPB1Q06547 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GABPB1Q06547 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GABPB1Q06547 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GABPB1Q06547 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GABPB1Q06547 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GABPB1Q06547 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GABPB1Q06547 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GABPB1Q06547 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GABPB1Q06547 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GABPB1Q06547 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GABPB1Q06547 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GABPB1Q06547 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GABPB1Q06547 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GABPB1Q06547 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GABPB1Q06547 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GABPB1Q06547 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GABPB1Q06547 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GABPB1Q06547 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GABPB1Q06547 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GABPB1Q06547 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GABPB1Q06547 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GABPB1Q06547 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GABPB1Q06547 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GABPB1Q06547 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GABPB1Q06547 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GABPB1Q06547 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GABPB1Q06547 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GABPB1Q06547 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GABPB1Q06547 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GABPB1Q06547 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GABPB1Q06547 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GABPB1Q06547 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GABPB1Q06547 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GABPB1Q06547 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GABPB1Q06547 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GABPB1Q06547 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GABPB1Q06547 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GABPB1Q06547 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GABPB1Q06547 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GABPB1Q06547 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GABPB1Q06547 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GABPB1Q06547 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GABPB1Q06547 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GABPB1Q06547 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GABPB1Q06547 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GABPB1Q06547 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GABPB1Q06547 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GABPB1Q06547 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GABPB1Q06547 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GABPB1Q06547 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GABPB1Q06547 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GABPB1Q06547 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GABPB1Q06547 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GABPB1Q06547 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GABPB1Q06547 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GABPB1Q06547 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GABPB1Q06547 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GABPB1Q06547 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GABPB1Q06547 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GABPB1Q06547 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GABPB1Q06547 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GABPB1Q06547 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GABPB1Q06547 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GABPB1Q06547 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GABPB1Q06547 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GABPB1Q06547 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GABPB1Q06547 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GABPB1Q06547 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GABPB1Q06547 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GABPB1Q06547 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GABPB1Q06547 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GABPB1Q06547 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GABPB1Q06547 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GABPB1Q06547 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms