Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MDM2Q00987 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MDM2Q00987 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MDM2Q00987 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MDM2Q00987 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MDM2Q00987 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MDM2Q00987 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MDM2Q00987 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MDM2Q00987 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MDM2Q00987 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MDM2Q00987 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MDM2Q00987 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MDM2Q00987 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MDM2Q00987 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
MDM2Q00987 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MDM2Q00987 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MDM2Q00987 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MDM2Q00987 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MDM2Q00987 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MDM2Q00987 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MDM2Q00987 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MDM2Q00987 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
MDM2Q00987 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
MDM2Q00987 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MDM2Q00987 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
MDM2Q00987 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
MDM2Q00987 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
MDM2Q00987 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MDM2Q00987 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
MDM2Q00987 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
MDM2Q00987 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MDM2Q00987 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
MDM2Q00987 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
MDM2Q00987 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
MDM2Q00987 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MDM2Q00987 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
MDM2Q00987 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MDM2Q00987 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
MDM2Q00987 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
MDM2Q00987 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
MDM2Q00987 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MDM2Q00987 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MDM2Q00987 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MDM2Q00987 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
MDM2Q00987 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MDM2Q00987 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
MDM2Q00987 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
MDM2Q00987 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
MDM2Q00987 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MDM2Q00987 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MDM2Q00987 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MDM2Q00987 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
MDM2Q00987 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
MDM2Q00987 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MDM2Q00987 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MDM2Q00987 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
MDM2Q00987 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MDM2Q00987 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MDM2Q00987 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
MDM2Q00987 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
MDM2Q00987 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
MDM2Q00987 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MDM2Q00987 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MDM2Q00987 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MDM2Q00987 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MDM2Q00987 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MDM2Q00987 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MDM2Q00987 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MDM2Q00987 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MDM2Q00987 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MDM2Q00987 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MDM2Q00987 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MDM2Q00987 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MDM2Q00987 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
MDM2Q00987 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MDM2Q00987 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
MDM2Q00987 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
MDM2Q00987 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MDM2Q00987 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MDM2Q00987 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MDM2Q00987 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MDM2Q00987 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MDM2Q00987 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MDM2Q00987 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MDM2Q00987 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MDM2Q00987 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MDM2Q00987 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MDM2Q00987 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
MDM2Q00987 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MDM2Q00987 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
MDM2Q00987 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MDM2Q00987 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
MDM2Q00987 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
MDM2Q00987 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MDM2Q00987 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MDM2Q00987 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MDM2Q00987 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
MDM2Q00987 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MDM2Q00987 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MDM2Q00987 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms