Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HPCAP84074 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPCAP84074 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPCAP84074 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPCAP84074 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPCAP84074 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPCAP84074 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPCAP84074 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPCAP84074 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPCAP84074 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPCAP84074 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HPCAP84074 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HPCAP84074 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPCAP84074 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPCAP84074 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPCAP84074 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPCAP84074 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPCAP84074 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPCAP84074 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPCAP84074 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPCAP84074 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPCAP84074 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPCAP84074 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPCAP84074 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPCAP84074 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPCAP84074 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPCAP84074 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPCAP84074 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPCAP84074 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPCAP84074 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HPCAP84074 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPCAP84074 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPCAP84074 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPCAP84074 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPCAP84074 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPCAP84074 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPCAP84074 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPCAP84074 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPCAP84074 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPCAP84074 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPCAP84074 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPCAP84074 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPCAP84074 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HPCAP84074 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPCAP84074 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPCAP84074 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPCAP84074 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPCAP84074 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPCAP84074 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPCAP84074 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPCAP84074 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPCAP84074 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HPCAP84074 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPCAP84074 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPCAP84074 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPCAP84074 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPCAP84074 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPCAP84074 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPCAP84074 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPCAP84074 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPCAP84074 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPCAP84074 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPCAP84074 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPCAP84074 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPCAP84074 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPCAP84074 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPCAP84074 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPCAP84074 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPCAP84074 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPCAP84074 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPCAP84074 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HPCAP84074 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPCAP84074 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPCAP84074 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPCAP84074 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPCAP84074 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPCAP84074 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPCAP84074 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPCAP84074 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPCAP84074 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPCAP84074 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPCAP84074 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPCAP84074 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HPCAP84074 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPCAP84074 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPCAP84074 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPCAP84074 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPCAP84074 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPCAP84074 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPCAP84074 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPCAP84074 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPCAP84074 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPCAP84074 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPCAP84074 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPCAP84074 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPCAP84074 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPCAP84074 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPCAP84074 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPCAP84074 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HPCAP84074 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms