Protein–RNA interactions for Protein: P82663

MRPS25, 28S ribosomal protein S25, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS25P82663 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MRPS25P82663 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MRPS25P82663 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MRPS25P82663 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MRPS25P82663 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MRPS25P82663 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MRPS25P82663 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MRPS25P82663 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MRPS25P82663 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MRPS25P82663 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MRPS25P82663 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
MRPS25P82663 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MRPS25P82663 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MRPS25P82663 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MRPS25P82663 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MRPS25P82663 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MRPS25P82663 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MRPS25P82663 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MRPS25P82663 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MRPS25P82663 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MRPS25P82663 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MRPS25P82663 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MRPS25P82663 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MRPS25P82663 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MRPS25P82663 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MRPS25P82663 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MRPS25P82663 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MRPS25P82663 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MRPS25P82663 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MRPS25P82663 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MRPS25P82663 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MRPS25P82663 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MRPS25P82663 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRPS25P82663 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRPS25P82663 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRPS25P82663 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MRPS25P82663 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MRPS25P82663 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MRPS25P82663 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MRPS25P82663 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPS25P82663 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MRPS25P82663 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MRPS25P82663 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MRPS25P82663 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MRPS25P82663 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MRPS25P82663 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MRPS25P82663 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MRPS25P82663 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
MRPS25P82663 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MRPS25P82663 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MRPS25P82663 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MRPS25P82663 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MRPS25P82663 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MRPS25P82663 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MRPS25P82663 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MRPS25P82663 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MRPS25P82663 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MRPS25P82663 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MRPS25P82663 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MRPS25P82663 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MRPS25P82663 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MRPS25P82663 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MRPS25P82663 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MRPS25P82663 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MRPS25P82663 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MRPS25P82663 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MRPS25P82663 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRPS25P82663 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRPS25P82663 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRPS25P82663 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MRPS25P82663 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MRPS25P82663 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRPS25P82663 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MRPS25P82663 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MRPS25P82663 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MRPS25P82663 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MRPS25P82663 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MRPS25P82663 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MRPS25P82663 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MRPS25P82663 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MRPS25P82663 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MRPS25P82663 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MRPS25P82663 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MRPS25P82663 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MRPS25P82663 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MRPS25P82663 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MRPS25P82663 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MRPS25P82663 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MRPS25P82663 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MRPS25P82663 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MRPS25P82663 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MRPS25P82663 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MRPS25P82663 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MRPS25P82663 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MRPS25P82663 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MRPS25P82663 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MRPS25P82663 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MRPS25P82663 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MRPS25P82663 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MRPS25P82663 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms