Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBA4AP68366 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBA4AP68366 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBA4AP68366 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBA4AP68366 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBA4AP68366 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBA4AP68366 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBA4AP68366 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBA4AP68366 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBA4AP68366 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBA4AP68366 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBA4AP68366 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBA4AP68366 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBA4AP68366 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBA4AP68366 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBA4AP68366 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBA4AP68366 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBA4AP68366 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBA4AP68366 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBA4AP68366 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBA4AP68366 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBA4AP68366 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TUBA4AP68366 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBA4AP68366 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBA4AP68366 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBA4AP68366 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBA4AP68366 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBA4AP68366 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBA4AP68366 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBA4AP68366 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBA4AP68366 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBA4AP68366 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBA4AP68366 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBA4AP68366 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBA4AP68366 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBA4AP68366 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBA4AP68366 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBA4AP68366 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBA4AP68366 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBA4AP68366 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBA4AP68366 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBA4AP68366 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBA4AP68366 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBA4AP68366 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBA4AP68366 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBA4AP68366 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBA4AP68366 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBA4AP68366 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBA4AP68366 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBA4AP68366 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBA4AP68366 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBA4AP68366 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBA4AP68366 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBA4AP68366 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBA4AP68366 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA4AP68366 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA4AP68366 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA4AP68366 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBA4AP68366 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBA4AP68366 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBA4AP68366 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBA4AP68366 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBA4AP68366 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBA4AP68366 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBA4AP68366 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBA4AP68366 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBA4AP68366 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBA4AP68366 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBA4AP68366 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBA4AP68366 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBA4AP68366 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBA4AP68366 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBA4AP68366 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBA4AP68366 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBA4AP68366 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBA4AP68366 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBA4AP68366 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBA4AP68366 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBA4AP68366 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBA4AP68366 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBA4AP68366 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBA4AP68366 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBA4AP68366 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBA4AP68366 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBA4AP68366 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBA4AP68366 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBA4AP68366 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBA4AP68366 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBA4AP68366 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBA4AP68366 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBA4AP68366 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBA4AP68366 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBA4AP68366 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBA4AP68366 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBA4AP68366 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBA4AP68366 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBA4AP68366 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBA4AP68366 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBA4AP68366 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBA4AP68366 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms