Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL39P62891 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL39P62891 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL39P62891 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL39P62891 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL39P62891 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL39P62891 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL39P62891 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL39P62891 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL39P62891 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL39P62891 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL39P62891 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL39P62891 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL39P62891 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL39P62891 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL39P62891 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL39P62891 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL39P62891 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL39P62891 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL39P62891 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL39P62891 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL39P62891 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL39P62891 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL39P62891 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL39P62891 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL39P62891 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL39P62891 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL39P62891 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL39P62891 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL39P62891 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL39P62891 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL39P62891 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL39P62891 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL39P62891 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL39P62891 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL39P62891 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL39P62891 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL39P62891 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL39P62891 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL39P62891 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL39P62891 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL39P62891 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL39P62891 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL39P62891 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL39P62891 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL39P62891 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL39P62891 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL39P62891 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL39P62891 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL39P62891 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL39P62891 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL39P62891 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL39P62891 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPL39P62891 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL39P62891 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL39P62891 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL39P62891 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL39P62891 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL39P62891 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL39P62891 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL39P62891 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL39P62891 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL39P62891 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL39P62891 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL39P62891 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL39P62891 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL39P62891 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL39P62891 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL39P62891 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL39P62891 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL39P62891 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL39P62891 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL39P62891 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL39P62891 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL39P62891 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL39P62891 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL39P62891 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL39P62891 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL39P62891 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL39P62891 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL39P62891 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL39P62891 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPL39P62891 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPL39P62891 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL39P62891 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL39P62891 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL39P62891 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL39P62891 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL39P62891 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL39P62891 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL39P62891 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL39P62891 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL39P62891 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL39P62891 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL39P62891 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL39P62891 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL39P62891 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL39P62891 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL39P62891 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL39P62891 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms