Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FXYD4P59646 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FXYD4P59646 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FXYD4P59646 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FXYD4P59646 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FXYD4P59646 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FXYD4P59646 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FXYD4P59646 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FXYD4P59646 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FXYD4P59646 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FXYD4P59646 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FXYD4P59646 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FXYD4P59646 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FXYD4P59646 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FXYD4P59646 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FXYD4P59646 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FXYD4P59646 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXYD4P59646 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXYD4P59646 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FXYD4P59646 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FXYD4P59646 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FXYD4P59646 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FXYD4P59646 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FXYD4P59646 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FXYD4P59646 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FXYD4P59646 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FXYD4P59646 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FXYD4P59646 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXYD4P59646 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FXYD4P59646 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FXYD4P59646 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FXYD4P59646 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FXYD4P59646 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FXYD4P59646 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FXYD4P59646 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FXYD4P59646 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FXYD4P59646 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FXYD4P59646 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FXYD4P59646 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FXYD4P59646 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FXYD4P59646 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FXYD4P59646 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FXYD4P59646 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FXYD4P59646 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FXYD4P59646 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FXYD4P59646 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FXYD4P59646 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FXYD4P59646 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FXYD4P59646 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FXYD4P59646 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FXYD4P59646 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FXYD4P59646 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FXYD4P59646 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FXYD4P59646 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FXYD4P59646 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FXYD4P59646 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FXYD4P59646 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FXYD4P59646 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FXYD4P59646 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FXYD4P59646 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FXYD4P59646 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FXYD4P59646 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FXYD4P59646 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FXYD4P59646 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FXYD4P59646 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FXYD4P59646 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FXYD4P59646 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FXYD4P59646 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FXYD4P59646 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FXYD4P59646 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FXYD4P59646 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FXYD4P59646 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FXYD4P59646 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FXYD4P59646 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FXYD4P59646 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FXYD4P59646 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FXYD4P59646 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FXYD4P59646 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FXYD4P59646 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FXYD4P59646 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FXYD4P59646 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FXYD4P59646 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FXYD4P59646 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FXYD4P59646 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FXYD4P59646 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FXYD4P59646 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FXYD4P59646 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FXYD4P59646 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FXYD4P59646 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FXYD4P59646 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FXYD4P59646 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FXYD4P59646 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FXYD4P59646 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FXYD4P59646 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FXYD4P59646 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FXYD4P59646 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FXYD4P59646 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FXYD4P59646 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FXYD4P59646 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FXYD4P59646 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms