Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GSDMDP57764 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GSDMDP57764 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GSDMDP57764 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GSDMDP57764 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GSDMDP57764 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GSDMDP57764 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GSDMDP57764 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GSDMDP57764 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GSDMDP57764 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GSDMDP57764 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GSDMDP57764 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GSDMDP57764 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GSDMDP57764 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GSDMDP57764 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GSDMDP57764 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
GSDMDP57764 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GSDMDP57764 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GSDMDP57764 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GSDMDP57764 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GSDMDP57764 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GSDMDP57764 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GSDMDP57764 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GSDMDP57764 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GSDMDP57764 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GSDMDP57764 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GSDMDP57764 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GSDMDP57764 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GSDMDP57764 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GSDMDP57764 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GSDMDP57764 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GSDMDP57764 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GSDMDP57764 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GSDMDP57764 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GSDMDP57764 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GSDMDP57764 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GSDMDP57764 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
GSDMDP57764 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
GSDMDP57764 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GSDMDP57764 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GSDMDP57764 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GSDMDP57764 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GSDMDP57764 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GSDMDP57764 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GSDMDP57764 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GSDMDP57764 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GSDMDP57764 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
GSDMDP57764 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GSDMDP57764 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GSDMDP57764 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GSDMDP57764 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GSDMDP57764 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GSDMDP57764 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GSDMDP57764 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GSDMDP57764 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GSDMDP57764 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GSDMDP57764 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GSDMDP57764 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GSDMDP57764 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GSDMDP57764 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GSDMDP57764 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GSDMDP57764 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GSDMDP57764 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GSDMDP57764 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GSDMDP57764 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GSDMDP57764 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GSDMDP57764 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GSDMDP57764 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GSDMDP57764 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GSDMDP57764 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GSDMDP57764 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GSDMDP57764 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GSDMDP57764 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GSDMDP57764 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GSDMDP57764 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GSDMDP57764 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GSDMDP57764 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GSDMDP57764 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GSDMDP57764 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GSDMDP57764 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GSDMDP57764 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GSDMDP57764 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GSDMDP57764 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GSDMDP57764 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GSDMDP57764 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GSDMDP57764 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GSDMDP57764 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GSDMDP57764 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GSDMDP57764 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GSDMDP57764 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GSDMDP57764 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GSDMDP57764 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GSDMDP57764 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
GSDMDP57764 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GSDMDP57764 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GSDMDP57764 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GSDMDP57764 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
GSDMDP57764 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GSDMDP57764 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GSDMDP57764 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms