Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP107P57740 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP107P57740 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP107P57740 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP107P57740 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP107P57740 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP107P57740 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP107P57740 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP107P57740 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP107P57740 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP107P57740 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP107P57740 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP107P57740 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP107P57740 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP107P57740 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP107P57740 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP107P57740 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP107P57740 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP107P57740 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP107P57740 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP107P57740 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP107P57740 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP107P57740 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP107P57740 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP107P57740 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP107P57740 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP107P57740 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP107P57740 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP107P57740 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP107P57740 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP107P57740 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP107P57740 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP107P57740 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP107P57740 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP107P57740 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP107P57740 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP107P57740 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP107P57740 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP107P57740 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP107P57740 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP107P57740 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP107P57740 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP107P57740 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP107P57740 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP107P57740 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP107P57740 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP107P57740 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP107P57740 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP107P57740 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP107P57740 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP107P57740 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP107P57740 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP107P57740 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP107P57740 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP107P57740 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP107P57740 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP107P57740 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP107P57740 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP107P57740 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP107P57740 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP107P57740 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP107P57740 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP107P57740 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP107P57740 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP107P57740 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP107P57740 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP107P57740 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP107P57740 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP107P57740 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP107P57740 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP107P57740 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP107P57740 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP107P57740 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP107P57740 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP107P57740 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP107P57740 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP107P57740 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP107P57740 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP107P57740 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP107P57740 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP107P57740 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP107P57740 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP107P57740 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP107P57740 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP107P57740 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP107P57740 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP107P57740 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP107P57740 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP107P57740 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP107P57740 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP107P57740 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP107P57740 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP107P57740 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP107P57740 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP107P57740 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP107P57740 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP107P57740 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP107P57740 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP107P57740 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP107P57740 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms