Protein–RNA interactions for Protein: P55316

FOXG1, Forkhead box protein G1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1P55316 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXG1P55316 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXG1P55316 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXG1P55316 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXG1P55316 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXG1P55316 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXG1P55316 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXG1P55316 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXG1P55316 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXG1P55316 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXG1P55316 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXG1P55316 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXG1P55316 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXG1P55316 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXG1P55316 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXG1P55316 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXG1P55316 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXG1P55316 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXG1P55316 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXG1P55316 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXG1P55316 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXG1P55316 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXG1P55316 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXG1P55316 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXG1P55316 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXG1P55316 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXG1P55316 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXG1P55316 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXG1P55316 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXG1P55316 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXG1P55316 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXG1P55316 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXG1P55316 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXG1P55316 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXG1P55316 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXG1P55316 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXG1P55316 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXG1P55316 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXG1P55316 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXG1P55316 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXG1P55316 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXG1P55316 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXG1P55316 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXG1P55316 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXG1P55316 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXG1P55316 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXG1P55316 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXG1P55316 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXG1P55316 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXG1P55316 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXG1P55316 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXG1P55316 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXG1P55316 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXG1P55316 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXG1P55316 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXG1P55316 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXG1P55316 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXG1P55316 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXG1P55316 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXG1P55316 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXG1P55316 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXG1P55316 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXG1P55316 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXG1P55316 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXG1P55316 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXG1P55316 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXG1P55316 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXG1P55316 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXG1P55316 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXG1P55316 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXG1P55316 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXG1P55316 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXG1P55316 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXG1P55316 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXG1P55316 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXG1P55316 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXG1P55316 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXG1P55316 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXG1P55316 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXG1P55316 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXG1P55316 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXG1P55316 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXG1P55316 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXG1P55316 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXG1P55316 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXG1P55316 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXG1P55316 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXG1P55316 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXG1P55316 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXG1P55316 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXG1P55316 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXG1P55316 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXG1P55316 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXG1P55316 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXG1P55316 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXG1P55316 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXG1P55316 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXG1P55316 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXG1P55316 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXG1P55316 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms