Protein–RNA interactions for Protein: P52799

EFNB2, Ephrin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB2P52799 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFNB2P52799 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFNB2P52799 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFNB2P52799 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFNB2P52799 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFNB2P52799 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFNB2P52799 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFNB2P52799 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFNB2P52799 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFNB2P52799 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
EFNB2P52799 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFNB2P52799 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFNB2P52799 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFNB2P52799 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFNB2P52799 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFNB2P52799 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFNB2P52799 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFNB2P52799 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFNB2P52799 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFNB2P52799 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFNB2P52799 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFNB2P52799 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFNB2P52799 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFNB2P52799 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFNB2P52799 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFNB2P52799 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFNB2P52799 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFNB2P52799 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFNB2P52799 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EFNB2P52799 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFNB2P52799 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFNB2P52799 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFNB2P52799 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFNB2P52799 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFNB2P52799 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFNB2P52799 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFNB2P52799 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFNB2P52799 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFNB2P52799 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFNB2P52799 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFNB2P52799 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFNB2P52799 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFNB2P52799 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFNB2P52799 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFNB2P52799 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFNB2P52799 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFNB2P52799 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFNB2P52799 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFNB2P52799 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EFNB2P52799 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFNB2P52799 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFNB2P52799 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFNB2P52799 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFNB2P52799 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFNB2P52799 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNB2P52799 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNB2P52799 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNB2P52799 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNB2P52799 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNB2P52799 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNB2P52799 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNB2P52799 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFNB2P52799 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFNB2P52799 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNB2P52799 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNB2P52799 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFNB2P52799 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFNB2P52799 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFNB2P52799 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNB2P52799 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNB2P52799 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNB2P52799 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNB2P52799 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNB2P52799 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNB2P52799 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNB2P52799 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFNB2P52799 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFNB2P52799 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFNB2P52799 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFNB2P52799 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFNB2P52799 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFNB2P52799 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFNB2P52799 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFNB2P52799 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFNB2P52799 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNB2P52799 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNB2P52799 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFNB2P52799 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EFNB2P52799 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFNB2P52799 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFNB2P52799 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EFNB2P52799 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFNB2P52799 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFNB2P52799 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFNB2P52799 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFNB2P52799 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFNB2P52799 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFNB2P52799 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFNB2P52799 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFNB2P52799 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms