Protein–RNA interactions for Protein: P51788

CLCN2, Chloride channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN2P51788 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLCN2P51788 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLCN2P51788 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLCN2P51788 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLCN2P51788 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLCN2P51788 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLCN2P51788 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN2P51788 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN2P51788 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLCN2P51788 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN2P51788 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN2P51788 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN2P51788 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN2P51788 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN2P51788 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN2P51788 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN2P51788 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN2P51788 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN2P51788 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLCN2P51788 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLCN2P51788 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLCN2P51788 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLCN2P51788 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLCN2P51788 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CLCN2P51788 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCN2P51788 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN2P51788 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN2P51788 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN2P51788 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN2P51788 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLCN2P51788 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLCN2P51788 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLCN2P51788 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLCN2P51788 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLCN2P51788 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLCN2P51788 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLCN2P51788 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLCN2P51788 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCN2P51788 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCN2P51788 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCN2P51788 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLCN2P51788 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLCN2P51788 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLCN2P51788 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLCN2P51788 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLCN2P51788 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLCN2P51788 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLCN2P51788 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCN2P51788 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLCN2P51788 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN2P51788 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCN2P51788 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCN2P51788 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCN2P51788 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLCN2P51788 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCN2P51788 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCN2P51788 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCN2P51788 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCN2P51788 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCN2P51788 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCN2P51788 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCN2P51788 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCN2P51788 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCN2P51788 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCN2P51788 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCN2P51788 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCN2P51788 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCN2P51788 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCN2P51788 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCN2P51788 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCN2P51788 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLCN2P51788 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLCN2P51788 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLCN2P51788 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLCN2P51788 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLCN2P51788 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLCN2P51788 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLCN2P51788 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLCN2P51788 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLCN2P51788 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLCN2P51788 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLCN2P51788 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLCN2P51788 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLCN2P51788 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLCN2P51788 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLCN2P51788 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLCN2P51788 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLCN2P51788 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLCN2P51788 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLCN2P51788 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLCN2P51788 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CLCN2P51788 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLCN2P51788 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLCN2P51788 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLCN2P51788 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLCN2P51788 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLCN2P51788 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCN2P51788 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCN2P51788 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCN2P51788 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms