Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RORCP51449 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RORCP51449 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RORCP51449 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RORCP51449 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RORCP51449 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RORCP51449 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RORCP51449 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RORCP51449 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RORCP51449 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RORCP51449 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RORCP51449 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RORCP51449 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RORCP51449 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RORCP51449 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RORCP51449 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RORCP51449 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RORCP51449 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RORCP51449 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RORCP51449 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RORCP51449 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RORCP51449 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RORCP51449 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RORCP51449 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RORCP51449 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RORCP51449 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RORCP51449 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RORCP51449 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RORCP51449 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RORCP51449 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RORCP51449 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RORCP51449 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RORCP51449 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RORCP51449 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RORCP51449 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RORCP51449 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RORCP51449 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RORCP51449 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RORCP51449 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RORCP51449 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RORCP51449 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RORCP51449 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RORCP51449 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RORCP51449 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RORCP51449 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RORCP51449 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RORCP51449 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RORCP51449 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RORCP51449 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RORCP51449 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RORCP51449 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RORCP51449 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RORCP51449 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RORCP51449 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RORCP51449 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RORCP51449 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RORCP51449 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RORCP51449 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RORCP51449 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RORCP51449 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RORCP51449 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RORCP51449 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RORCP51449 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RORCP51449 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RORCP51449 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RORCP51449 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RORCP51449 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RORCP51449 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RORCP51449 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RORCP51449 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RORCP51449 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RORCP51449 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RORCP51449 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RORCP51449 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RORCP51449 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RORCP51449 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RORCP51449 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RORCP51449 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RORCP51449 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RORCP51449 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RORCP51449 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RORCP51449 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RORCP51449 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RORCP51449 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RORCP51449 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RORCP51449 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RORCP51449 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RORCP51449 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RORCP51449 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RORCP51449 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RORCP51449 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RORCP51449 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RORCP51449 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RORCP51449 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RORCP51449 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RORCP51449 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RORCP51449 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RORCP51449 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RORCP51449 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RORCP51449 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms