Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMAN1P49257 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMAN1P49257 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMAN1P49257 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMAN1P49257 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMAN1P49257 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMAN1P49257 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMAN1P49257 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMAN1P49257 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMAN1P49257 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LMAN1P49257 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMAN1P49257 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMAN1P49257 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMAN1P49257 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMAN1P49257 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMAN1P49257 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMAN1P49257 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMAN1P49257 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMAN1P49257 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMAN1P49257 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMAN1P49257 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMAN1P49257 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMAN1P49257 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMAN1P49257 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LMAN1P49257 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMAN1P49257 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMAN1P49257 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMAN1P49257 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMAN1P49257 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LMAN1P49257 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMAN1P49257 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMAN1P49257 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMAN1P49257 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LMAN1P49257 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMAN1P49257 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMAN1P49257 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMAN1P49257 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMAN1P49257 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMAN1P49257 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMAN1P49257 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMAN1P49257 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMAN1P49257 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMAN1P49257 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMAN1P49257 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMAN1P49257 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMAN1P49257 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMAN1P49257 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMAN1P49257 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMAN1P49257 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMAN1P49257 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMAN1P49257 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMAN1P49257 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMAN1P49257 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMAN1P49257 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMAN1P49257 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMAN1P49257 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LMAN1P49257 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMAN1P49257 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMAN1P49257 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMAN1P49257 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMAN1P49257 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMAN1P49257 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMAN1P49257 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMAN1P49257 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMAN1P49257 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMAN1P49257 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMAN1P49257 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMAN1P49257 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMAN1P49257 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMAN1P49257 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMAN1P49257 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMAN1P49257 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMAN1P49257 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMAN1P49257 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMAN1P49257 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMAN1P49257 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMAN1P49257 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMAN1P49257 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMAN1P49257 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMAN1P49257 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMAN1P49257 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMAN1P49257 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMAN1P49257 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMAN1P49257 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMAN1P49257 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMAN1P49257 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMAN1P49257 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMAN1P49257 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMAN1P49257 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMAN1P49257 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMAN1P49257 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMAN1P49257 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMAN1P49257 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMAN1P49257 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMAN1P49257 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMAN1P49257 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMAN1P49257 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMAN1P49257 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMAN1P49257 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMAN1P49257 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms