Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDKN1BP46527 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDKN1BP46527 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN1BP46527 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CDKN1BP46527 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN1BP46527 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN1BP46527 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN1BP46527 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDKN1BP46527 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN1BP46527 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN1BP46527 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN1BP46527 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN1BP46527 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN1BP46527 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDKN1BP46527 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDKN1BP46527 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN1BP46527 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN1BP46527 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN1BP46527 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN1BP46527 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDKN1BP46527 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDKN1BP46527 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN1BP46527 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN1BP46527 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKN1BP46527 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKN1BP46527 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKN1BP46527 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKN1BP46527 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKN1BP46527 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKN1BP46527 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDKN1BP46527 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDKN1BP46527 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDKN1BP46527 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDKN1BP46527 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDKN1BP46527 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN1BP46527 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN1BP46527 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN1BP46527 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN1BP46527 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN1BP46527 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN1BP46527 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN1BP46527 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN1BP46527 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDKN1BP46527 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN1BP46527 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKN1BP46527 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN1BP46527 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN1BP46527 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN1BP46527 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN1BP46527 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN1BP46527 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN1BP46527 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN1BP46527 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN1BP46527 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN1BP46527 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN1BP46527 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKN1BP46527 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN1BP46527 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN1BP46527 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN1BP46527 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN1BP46527 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKN1BP46527 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKN1BP46527 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKN1BP46527 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKN1BP46527 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKN1BP46527 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKN1BP46527 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN1BP46527 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN1BP46527 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN1BP46527 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN1BP46527 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN1BP46527 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN1BP46527 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKN1BP46527 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDKN1BP46527 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDKN1BP46527 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDKN1BP46527 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDKN1BP46527 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDKN1BP46527 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDKN1BP46527 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDKN1BP46527 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN1BP46527 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN1BP46527 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN1BP46527 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN1BP46527 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN1BP46527 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN1BP46527 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN1BP46527 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN1BP46527 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN1BP46527 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN1BP46527 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN1BP46527 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN1BP46527 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN1BP46527 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN1BP46527 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDKN1BP46527 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKN1BP46527 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKN1BP46527 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN1BP46527 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN1BP46527 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms