Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XCR1P46094 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XCR1P46094 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XCR1P46094 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
XCR1P46094 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XCR1P46094 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XCR1P46094 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XCR1P46094 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XCR1P46094 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XCR1P46094 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XCR1P46094 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XCR1P46094 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XCR1P46094 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XCR1P46094 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
XCR1P46094 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
XCR1P46094 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XCR1P46094 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XCR1P46094 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XCR1P46094 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XCR1P46094 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XCR1P46094 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XCR1P46094 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XCR1P46094 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XCR1P46094 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XCR1P46094 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XCR1P46094 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XCR1P46094 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XCR1P46094 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XCR1P46094 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XCR1P46094 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XCR1P46094 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XCR1P46094 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XCR1P46094 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XCR1P46094 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XCR1P46094 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XCR1P46094 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XCR1P46094 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XCR1P46094 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XCR1P46094 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XCR1P46094 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
XCR1P46094 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XCR1P46094 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
XCR1P46094 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XCR1P46094 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XCR1P46094 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XCR1P46094 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XCR1P46094 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XCR1P46094 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XCR1P46094 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XCR1P46094 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XCR1P46094 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XCR1P46094 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XCR1P46094 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XCR1P46094 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XCR1P46094 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XCR1P46094 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
XCR1P46094 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XCR1P46094 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XCR1P46094 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XCR1P46094 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XCR1P46094 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XCR1P46094 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XCR1P46094 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
XCR1P46094 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XCR1P46094 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XCR1P46094 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XCR1P46094 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XCR1P46094 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XCR1P46094 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XCR1P46094 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XCR1P46094 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XCR1P46094 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
XCR1P46094 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XCR1P46094 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XCR1P46094 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XCR1P46094 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XCR1P46094 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XCR1P46094 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XCR1P46094 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XCR1P46094 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
XCR1P46094 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XCR1P46094 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XCR1P46094 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XCR1P46094 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XCR1P46094 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
XCR1P46094 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
XCR1P46094 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XCR1P46094 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XCR1P46094 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XCR1P46094 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XCR1P46094 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XCR1P46094 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XCR1P46094 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XCR1P46094 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XCR1P46094 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XCR1P46094 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XCR1P46094 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XCR1P46094 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XCR1P46094 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XCR1P46094 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms