Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNNT3P45378 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNNT3P45378 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNNT3P45378 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNNT3P45378 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TNNT3P45378 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNNT3P45378 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNNT3P45378 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNNT3P45378 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNNT3P45378 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNNT3P45378 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNNT3P45378 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNT3P45378 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNT3P45378 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNT3P45378 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNT3P45378 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNT3P45378 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNT3P45378 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNT3P45378 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNT3P45378 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNT3P45378 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNT3P45378 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNT3P45378 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNT3P45378 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNNT3P45378 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNT3P45378 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNT3P45378 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNT3P45378 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNT3P45378 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNT3P45378 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNT3P45378 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNT3P45378 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNNT3P45378 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNNT3P45378 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNT3P45378 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNT3P45378 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNT3P45378 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNT3P45378 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNT3P45378 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNT3P45378 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNT3P45378 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNT3P45378 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNT3P45378 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNT3P45378 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNT3P45378 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNT3P45378 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNNT3P45378 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNNT3P45378 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNNT3P45378 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNT3P45378 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNT3P45378 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNT3P45378 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNT3P45378 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNT3P45378 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNT3P45378 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNT3P45378 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNT3P45378 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNT3P45378 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNT3P45378 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNT3P45378 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNNT3P45378 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNNT3P45378 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TNNT3P45378 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNT3P45378 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNT3P45378 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNNT3P45378 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNT3P45378 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNT3P45378 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNT3P45378 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNNT3P45378 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNT3P45378 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNT3P45378 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNT3P45378 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNT3P45378 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNT3P45378 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNT3P45378 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNT3P45378 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNT3P45378 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNT3P45378 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNT3P45378 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNT3P45378 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNT3P45378 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNT3P45378 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNT3P45378 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNT3P45378 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNT3P45378 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNT3P45378 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNT3P45378 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNT3P45378 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TNNT3P45378 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNT3P45378 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNT3P45378 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNT3P45378 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNT3P45378 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNT3P45378 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNNT3P45378 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNNT3P45378 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNT3P45378 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNT3P45378 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNT3P45378 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms