Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRATP43155 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRATP43155 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRATP43155 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRATP43155 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRATP43155 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CRATP43155 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRATP43155 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRATP43155 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRATP43155 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRATP43155 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRATP43155 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRATP43155 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRATP43155 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRATP43155 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRATP43155 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRATP43155 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRATP43155 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRATP43155 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRATP43155 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRATP43155 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRATP43155 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRATP43155 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRATP43155 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRATP43155 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRATP43155 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRATP43155 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRATP43155 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRATP43155 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRATP43155 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRATP43155 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRATP43155 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CRATP43155 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CRATP43155 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRATP43155 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRATP43155 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRATP43155 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRATP43155 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRATP43155 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRATP43155 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRATP43155 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRATP43155 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CRATP43155 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRATP43155 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRATP43155 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRATP43155 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRATP43155 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRATP43155 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRATP43155 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRATP43155 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRATP43155 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRATP43155 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRATP43155 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRATP43155 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRATP43155 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRATP43155 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRATP43155 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRATP43155 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRATP43155 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CRATP43155 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRATP43155 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRATP43155 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRATP43155 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRATP43155 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRATP43155 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRATP43155 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRATP43155 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRATP43155 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRATP43155 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRATP43155 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRATP43155 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRATP43155 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRATP43155 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRATP43155 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRATP43155 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRATP43155 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRATP43155 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRATP43155 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRATP43155 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRATP43155 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRATP43155 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRATP43155 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRATP43155 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRATP43155 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRATP43155 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRATP43155 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRATP43155 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRATP43155 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRATP43155 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CRATP43155 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRATP43155 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRATP43155 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRATP43155 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CRATP43155 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRATP43155 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRATP43155 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRATP43155 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRATP43155 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRATP43155 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRATP43155 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms