Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL5P42830 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CXCL5P42830 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL5P42830 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL5P42830 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL5P42830 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL5P42830 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL5P42830 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL5P42830 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL5P42830 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL5P42830 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL5P42830 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL5P42830 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL5P42830 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL5P42830 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL5P42830 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL5P42830 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL5P42830 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL5P42830 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL5P42830 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL5P42830 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL5P42830 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL5P42830 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL5P42830 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL5P42830 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CXCL5P42830 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL5P42830 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL5P42830 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL5P42830 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL5P42830 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL5P42830 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL5P42830 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL5P42830 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL5P42830 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL5P42830 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL5P42830 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL5P42830 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL5P42830 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL5P42830 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL5P42830 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL5P42830 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL5P42830 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL5P42830 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL5P42830 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CXCL5P42830 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL5P42830 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CXCL5P42830 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL5P42830 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL5P42830 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL5P42830 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CXCL5P42830 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL5P42830 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CXCL5P42830 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL5P42830 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL5P42830 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL5P42830 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL5P42830 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL5P42830 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL5P42830 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL5P42830 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL5P42830 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL5P42830 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL5P42830 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL5P42830 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL5P42830 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL5P42830 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL5P42830 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL5P42830 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL5P42830 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL5P42830 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL5P42830 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL5P42830 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL5P42830 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL5P42830 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL5P42830 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL5P42830 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL5P42830 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL5P42830 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL5P42830 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL5P42830 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL5P42830 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL5P42830 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL5P42830 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL5P42830 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL5P42830 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL5P42830 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL5P42830 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL5P42830 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL5P42830 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL5P42830 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL5P42830 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL5P42830 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL5P42830 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL5P42830 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL5P42830 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL5P42830 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL5P42830 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL5P42830 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL5P42830 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms