Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HSPA9P38646 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSPA9P38646 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSPA9P38646 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSPA9P38646 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSPA9P38646 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSPA9P38646 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSPA9P38646 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSPA9P38646 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSPA9P38646 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HSPA9P38646 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSPA9P38646 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSPA9P38646 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSPA9P38646 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSPA9P38646 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HSPA9P38646 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSPA9P38646 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSPA9P38646 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSPA9P38646 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSPA9P38646 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSPA9P38646 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSPA9P38646 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSPA9P38646 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HSPA9P38646 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSPA9P38646 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSPA9P38646 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSPA9P38646 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
HSPA9P38646 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSPA9P38646 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSPA9P38646 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSPA9P38646 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HSPA9P38646 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HSPA9P38646 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSPA9P38646 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSPA9P38646 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HSPA9P38646 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HSPA9P38646 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HSPA9P38646 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HSPA9P38646 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HSPA9P38646 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HSPA9P38646 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSPA9P38646 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HSPA9P38646 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSPA9P38646 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
HSPA9P38646 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
HSPA9P38646 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HSPA9P38646 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSPA9P38646 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSPA9P38646 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HSPA9P38646 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HSPA9P38646 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HSPA9P38646 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HSPA9P38646 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HSPA9P38646 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSPA9P38646 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSPA9P38646 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HSPA9P38646 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HSPA9P38646 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HSPA9P38646 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HSPA9P38646 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HSPA9P38646 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HSPA9P38646 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HSPA9P38646 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HSPA9P38646 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HSPA9P38646 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HSPA9P38646 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HSPA9P38646 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HSPA9P38646 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HSPA9P38646 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HSPA9P38646 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HSPA9P38646 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HSPA9P38646 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HSPA9P38646 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HSPA9P38646 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HSPA9P38646 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HSPA9P38646 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HSPA9P38646 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HSPA9P38646 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HSPA9P38646 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HSPA9P38646 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HSPA9P38646 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HSPA9P38646 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HSPA9P38646 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HSPA9P38646 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HSPA9P38646 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HSPA9P38646 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HSPA9P38646 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HSPA9P38646 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HSPA9P38646 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HSPA9P38646 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HSPA9P38646 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HSPA9P38646 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HSPA9P38646 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HSPA9P38646 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
HSPA9P38646 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HSPA9P38646 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HSPA9P38646 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HSPA9P38646 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HSPA9P38646 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HSPA9P38646 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms