Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FDFT1P37268 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FDFT1P37268 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FDFT1P37268 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FDFT1P37268 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FDFT1P37268 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FDFT1P37268 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FDFT1P37268 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FDFT1P37268 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FDFT1P37268 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FDFT1P37268 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FDFT1P37268 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FDFT1P37268 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FDFT1P37268 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FDFT1P37268 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FDFT1P37268 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FDFT1P37268 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FDFT1P37268 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FDFT1P37268 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FDFT1P37268 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FDFT1P37268 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FDFT1P37268 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FDFT1P37268 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FDFT1P37268 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FDFT1P37268 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FDFT1P37268 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FDFT1P37268 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FDFT1P37268 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FDFT1P37268 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FDFT1P37268 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FDFT1P37268 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FDFT1P37268 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FDFT1P37268 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FDFT1P37268 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FDFT1P37268 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FDFT1P37268 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FDFT1P37268 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FDFT1P37268 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FDFT1P37268 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FDFT1P37268 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FDFT1P37268 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FDFT1P37268 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FDFT1P37268 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FDFT1P37268 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FDFT1P37268 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FDFT1P37268 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FDFT1P37268 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FDFT1P37268 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FDFT1P37268 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FDFT1P37268 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FDFT1P37268 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FDFT1P37268 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FDFT1P37268 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FDFT1P37268 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FDFT1P37268 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FDFT1P37268 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FDFT1P37268 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FDFT1P37268 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FDFT1P37268 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FDFT1P37268 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FDFT1P37268 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FDFT1P37268 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FDFT1P37268 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FDFT1P37268 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FDFT1P37268 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FDFT1P37268 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FDFT1P37268 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FDFT1P37268 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FDFT1P37268 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FDFT1P37268 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FDFT1P37268 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FDFT1P37268 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FDFT1P37268 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FDFT1P37268 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FDFT1P37268 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FDFT1P37268 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FDFT1P37268 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FDFT1P37268 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FDFT1P37268 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FDFT1P37268 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FDFT1P37268 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FDFT1P37268 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FDFT1P37268 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FDFT1P37268 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FDFT1P37268 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FDFT1P37268 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FDFT1P37268 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FDFT1P37268 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FDFT1P37268 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FDFT1P37268 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FDFT1P37268 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FDFT1P37268 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FDFT1P37268 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FDFT1P37268 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FDFT1P37268 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FDFT1P37268 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FDFT1P37268 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FDFT1P37268 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FDFT1P37268 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FDFT1P37268 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.3 ms