Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP62P37198 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP62P37198 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP62P37198 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP62P37198 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP62P37198 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP62P37198 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP62P37198 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP62P37198 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP62P37198 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP62P37198 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP62P37198 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP62P37198 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP62P37198 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62P37198 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP62P37198 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP62P37198 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP62P37198 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP62P37198 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP62P37198 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP62P37198 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP62P37198 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP62P37198 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP62P37198 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP62P37198 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP62P37198 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP62P37198 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP62P37198 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP62P37198 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP62P37198 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP62P37198 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP62P37198 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP62P37198 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP62P37198 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP62P37198 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP62P37198 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP62P37198 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP62P37198 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP62P37198 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP62P37198 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP62P37198 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP62P37198 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP62P37198 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP62P37198 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP62P37198 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP62P37198 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP62P37198 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP62P37198 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP62P37198 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP62P37198 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP62P37198 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP62P37198 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP62P37198 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP62P37198 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP62P37198 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP62P37198 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP62P37198 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP62P37198 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP62P37198 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP62P37198 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP62P37198 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP62P37198 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP62P37198 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP62P37198 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP62P37198 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP62P37198 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP62P37198 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP62P37198 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP62P37198 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUP62P37198 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP62P37198 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP62P37198 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP62P37198 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP62P37198 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP62P37198 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP62P37198 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP62P37198 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP62P37198 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP62P37198 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP62P37198 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP62P37198 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP62P37198 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP62P37198 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP62P37198 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP62P37198 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP62P37198 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP62P37198 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP62P37198 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP62P37198 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP62P37198 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP62P37198 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP62P37198 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP62P37198 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP62P37198 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP62P37198 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP62P37198 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP62P37198 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP62P37198 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP62P37198 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP62P37198 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms