Protein–RNA interactions for Protein: P35712

SOX6, Transcription factor SOX-6, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6P35712 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX6P35712 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX6P35712 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SOX6P35712 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX6P35712 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX6P35712 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX6P35712 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX6P35712 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX6P35712 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX6P35712 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX6P35712 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX6P35712 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX6P35712 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX6P35712 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX6P35712 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX6P35712 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX6P35712 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX6P35712 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX6P35712 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX6P35712 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX6P35712 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX6P35712 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX6P35712 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX6P35712 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX6P35712 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX6P35712 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX6P35712 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX6P35712 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX6P35712 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX6P35712 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX6P35712 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX6P35712 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX6P35712 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX6P35712 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX6P35712 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SOX6P35712 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX6P35712 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX6P35712 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX6P35712 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX6P35712 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX6P35712 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX6P35712 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX6P35712 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX6P35712 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX6P35712 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX6P35712 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX6P35712 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX6P35712 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOX6P35712 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOX6P35712 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX6P35712 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX6P35712 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX6P35712 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX6P35712 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX6P35712 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX6P35712 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX6P35712 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX6P35712 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX6P35712 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX6P35712 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX6P35712 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SOX6P35712 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX6P35712 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX6P35712 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX6P35712 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX6P35712 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX6P35712 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX6P35712 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX6P35712 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX6P35712 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX6P35712 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX6P35712 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX6P35712 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX6P35712 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX6P35712 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX6P35712 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX6P35712 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX6P35712 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX6P35712 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX6P35712 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX6P35712 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX6P35712 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX6P35712 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX6P35712 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX6P35712 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX6P35712 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX6P35712 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX6P35712 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX6P35712 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SOX6P35712 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX6P35712 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX6P35712 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX6P35712 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX6P35712 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX6P35712 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX6P35712 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX6P35712 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX6P35712 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX6P35712 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX6P35712 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms