Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP214P35658 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP214P35658 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP214P35658 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP214P35658 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP214P35658 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP214P35658 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP214P35658 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP214P35658 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP214P35658 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP214P35658 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP214P35658 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP214P35658 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP214P35658 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP214P35658 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP214P35658 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP214P35658 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP214P35658 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP214P35658 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP214P35658 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP214P35658 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP214P35658 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP214P35658 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP214P35658 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP214P35658 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP214P35658 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP214P35658 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP214P35658 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP214P35658 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP214P35658 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP214P35658 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP214P35658 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP214P35658 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP214P35658 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP214P35658 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP214P35658 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP214P35658 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP214P35658 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP214P35658 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP214P35658 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP214P35658 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP214P35658 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP214P35658 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP214P35658 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP214P35658 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP214P35658 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP214P35658 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP214P35658 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP214P35658 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP214P35658 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP214P35658 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP214P35658 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP214P35658 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP214P35658 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP214P35658 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP214P35658 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP214P35658 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP214P35658 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP214P35658 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP214P35658 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP214P35658 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP214P35658 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP214P35658 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP214P35658 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP214P35658 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP214P35658 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP214P35658 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP214P35658 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP214P35658 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP214P35658 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP214P35658 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP214P35658 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP214P35658 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP214P35658 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP214P35658 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP214P35658 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP214P35658 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP214P35658 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP214P35658 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP214P35658 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP214P35658 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP214P35658 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP214P35658 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP214P35658 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP214P35658 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP214P35658 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP214P35658 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP214P35658 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NUP214P35658 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP214P35658 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP214P35658 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP214P35658 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP214P35658 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP214P35658 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP214P35658 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP214P35658 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP214P35658 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP214P35658 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP214P35658 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP214P35658 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms