Protein–RNA interactions for Protein: P31949

S100A11, Protein S100-A11, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A11P31949 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
S100A11P31949 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
S100A11P31949 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
S100A11P31949 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
S100A11P31949 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
S100A11P31949 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
S100A11P31949 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
S100A11P31949 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
S100A11P31949 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
S100A11P31949 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
S100A11P31949 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
S100A11P31949 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
S100A11P31949 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
S100A11P31949 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
S100A11P31949 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
S100A11P31949 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S100A11P31949 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S100A11P31949 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
S100A11P31949 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
S100A11P31949 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
S100A11P31949 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
S100A11P31949 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
S100A11P31949 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S100A11P31949 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
S100A11P31949 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
S100A11P31949 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
S100A11P31949 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
S100A11P31949 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
S100A11P31949 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
S100A11P31949 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
S100A11P31949 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
S100A11P31949 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
S100A11P31949 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
S100A11P31949 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
S100A11P31949 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S100A11P31949 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S100A11P31949 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
S100A11P31949 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S100A11P31949 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S100A11P31949 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S100A11P31949 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S100A11P31949 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S100A11P31949 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
S100A11P31949 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
S100A11P31949 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
S100A11P31949 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
S100A11P31949 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
S100A11P31949 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
S100A11P31949 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
S100A11P31949 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
S100A11P31949 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
S100A11P31949 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
S100A11P31949 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
S100A11P31949 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
S100A11P31949 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
S100A11P31949 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
S100A11P31949 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
S100A11P31949 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
S100A11P31949 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
S100A11P31949 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
S100A11P31949 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
S100A11P31949 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
S100A11P31949 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
S100A11P31949 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
S100A11P31949 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
S100A11P31949 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
S100A11P31949 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
S100A11P31949 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
S100A11P31949 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
S100A11P31949 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
S100A11P31949 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
S100A11P31949 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
S100A11P31949 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
S100A11P31949 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
S100A11P31949 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
S100A11P31949 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
S100A11P31949 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
S100A11P31949 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
S100A11P31949 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
S100A11P31949 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
S100A11P31949 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
S100A11P31949 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
S100A11P31949 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
S100A11P31949 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
S100A11P31949 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
S100A11P31949 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
S100A11P31949 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
S100A11P31949 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
S100A11P31949 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
S100A11P31949 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
S100A11P31949 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
S100A11P31949 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
S100A11P31949 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
S100A11P31949 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
S100A11P31949 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
S100A11P31949 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
S100A11P31949 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
S100A11P31949 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
S100A11P31949 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
S100A11P31949 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms