Protein–RNA interactions for Protein: P26572

MGAT1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT1P26572 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MGAT1P26572 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MGAT1P26572 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MGAT1P26572 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MGAT1P26572 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MGAT1P26572 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MGAT1P26572 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MGAT1P26572 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MGAT1P26572 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MGAT1P26572 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MGAT1P26572 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MGAT1P26572 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MGAT1P26572 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MGAT1P26572 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MGAT1P26572 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MGAT1P26572 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MGAT1P26572 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MGAT1P26572 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MGAT1P26572 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MGAT1P26572 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MGAT1P26572 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MGAT1P26572 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MGAT1P26572 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MGAT1P26572 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MGAT1P26572 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MGAT1P26572 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MGAT1P26572 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MGAT1P26572 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MGAT1P26572 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MGAT1P26572 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MGAT1P26572 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MGAT1P26572 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MGAT1P26572 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MGAT1P26572 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MGAT1P26572 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MGAT1P26572 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MGAT1P26572 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MGAT1P26572 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MGAT1P26572 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MGAT1P26572 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MGAT1P26572 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MGAT1P26572 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MGAT1P26572 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MGAT1P26572 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MGAT1P26572 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MGAT1P26572 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MGAT1P26572 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MGAT1P26572 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MGAT1P26572 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MGAT1P26572 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MGAT1P26572 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MGAT1P26572 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MGAT1P26572 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MGAT1P26572 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MGAT1P26572 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MGAT1P26572 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MGAT1P26572 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MGAT1P26572 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MGAT1P26572 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MGAT1P26572 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MGAT1P26572 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MGAT1P26572 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MGAT1P26572 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MGAT1P26572 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MGAT1P26572 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MGAT1P26572 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MGAT1P26572 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MGAT1P26572 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MGAT1P26572 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MGAT1P26572 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MGAT1P26572 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MGAT1P26572 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MGAT1P26572 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MGAT1P26572 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MGAT1P26572 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MGAT1P26572 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MGAT1P26572 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MGAT1P26572 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MGAT1P26572 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MGAT1P26572 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MGAT1P26572 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MGAT1P26572 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MGAT1P26572 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MGAT1P26572 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MGAT1P26572 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MGAT1P26572 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MGAT1P26572 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MGAT1P26572 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MGAT1P26572 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MGAT1P26572 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MGAT1P26572 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MGAT1P26572 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MGAT1P26572 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MGAT1P26572 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MGAT1P26572 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MGAT1P26572 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MGAT1P26572 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MGAT1P26572 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MGAT1P26572 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MGAT1P26572 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms