Protein–RNA interactions for Protein: P25063

CD24, Signal transducer CD24, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD24P25063 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD24P25063 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD24P25063 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD24P25063 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD24P25063 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD24P25063 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD24P25063 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD24P25063 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD24P25063 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CD24P25063 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD24P25063 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD24P25063 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD24P25063 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD24P25063 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD24P25063 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD24P25063 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD24P25063 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD24P25063 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD24P25063 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD24P25063 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD24P25063 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD24P25063 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD24P25063 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD24P25063 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD24P25063 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD24P25063 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD24P25063 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD24P25063 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD24P25063 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD24P25063 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD24P25063 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD24P25063 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD24P25063 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD24P25063 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD24P25063 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD24P25063 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD24P25063 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD24P25063 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CD24P25063 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD24P25063 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD24P25063 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD24P25063 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD24P25063 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD24P25063 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD24P25063 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD24P25063 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD24P25063 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD24P25063 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD24P25063 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD24P25063 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD24P25063 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD24P25063 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD24P25063 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD24P25063 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD24P25063 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD24P25063 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CD24P25063 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD24P25063 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD24P25063 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD24P25063 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD24P25063 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD24P25063 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD24P25063 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CD24P25063 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD24P25063 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD24P25063 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD24P25063 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD24P25063 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD24P25063 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD24P25063 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD24P25063 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD24P25063 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD24P25063 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD24P25063 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD24P25063 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD24P25063 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD24P25063 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD24P25063 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD24P25063 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD24P25063 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD24P25063 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD24P25063 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD24P25063 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD24P25063 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD24P25063 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD24P25063 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD24P25063 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD24P25063 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD24P25063 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD24P25063 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD24P25063 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD24P25063 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CD24P25063 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD24P25063 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CD24P25063 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD24P25063 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD24P25063 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD24P25063 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD24P25063 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD24P25063 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms