Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPH2P23942 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPH2P23942 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPH2P23942 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPH2P23942 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPH2P23942 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPH2P23942 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPH2P23942 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPH2P23942 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPH2P23942 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPH2P23942 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRPH2P23942 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPH2P23942 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPH2P23942 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPH2P23942 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPH2P23942 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPH2P23942 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPH2P23942 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPH2P23942 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPH2P23942 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPH2P23942 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPH2P23942 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPH2P23942 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPH2P23942 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPH2P23942 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPH2P23942 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPH2P23942 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPH2P23942 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPH2P23942 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPH2P23942 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPH2P23942 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPH2P23942 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPH2P23942 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPH2P23942 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPH2P23942 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPH2P23942 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPH2P23942 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPH2P23942 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRPH2P23942 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPH2P23942 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPH2P23942 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPH2P23942 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPH2P23942 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPH2P23942 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPH2P23942 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPH2P23942 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPH2P23942 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPH2P23942 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPH2P23942 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPH2P23942 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPH2P23942 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPH2P23942 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPH2P23942 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPH2P23942 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPH2P23942 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPH2P23942 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPH2P23942 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPH2P23942 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPH2P23942 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPH2P23942 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPH2P23942 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPH2P23942 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPH2P23942 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPH2P23942 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPH2P23942 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPH2P23942 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPH2P23942 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPH2P23942 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPH2P23942 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPH2P23942 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPH2P23942 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPH2P23942 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPH2P23942 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPH2P23942 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPH2P23942 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPH2P23942 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPH2P23942 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPH2P23942 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPH2P23942 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPH2P23942 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPH2P23942 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPH2P23942 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPH2P23942 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPH2P23942 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPH2P23942 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPH2P23942 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPH2P23942 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPH2P23942 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPH2P23942 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPH2P23942 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPH2P23942 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPH2P23942 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPH2P23942 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPH2P23942 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPH2P23942 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPH2P23942 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPH2P23942 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPH2P23942 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPH2P23942 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPH2P23942 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms