Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRZ1P23471 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRZ1P23471 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRZ1P23471 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRZ1P23471 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRZ1P23471 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRZ1P23471 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRZ1P23471 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRZ1P23471 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRZ1P23471 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRZ1P23471 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRZ1P23471 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRZ1P23471 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRZ1P23471 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRZ1P23471 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRZ1P23471 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRZ1P23471 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRZ1P23471 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRZ1P23471 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRZ1P23471 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRZ1P23471 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRZ1P23471 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRZ1P23471 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRZ1P23471 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRZ1P23471 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRZ1P23471 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRZ1P23471 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRZ1P23471 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRZ1P23471 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRZ1P23471 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRZ1P23471 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRZ1P23471 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRZ1P23471 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRZ1P23471 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRZ1P23471 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRZ1P23471 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRZ1P23471 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRZ1P23471 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRZ1P23471 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRZ1P23471 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRZ1P23471 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRZ1P23471 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRZ1P23471 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRZ1P23471 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRZ1P23471 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRZ1P23471 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRZ1P23471 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRZ1P23471 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRZ1P23471 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRZ1P23471 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRZ1P23471 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRZ1P23471 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRZ1P23471 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRZ1P23471 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRZ1P23471 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRZ1P23471 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRZ1P23471 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRZ1P23471 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRZ1P23471 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRZ1P23471 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRZ1P23471 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRZ1P23471 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRZ1P23471 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
PTPRZ1P23471 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PTPRZ1P23471 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRZ1P23471 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRZ1P23471 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRZ1P23471 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRZ1P23471 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRZ1P23471 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRZ1P23471 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRZ1P23471 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRZ1P23471 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRZ1P23471 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRZ1P23471 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRZ1P23471 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRZ1P23471 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRZ1P23471 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRZ1P23471 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRZ1P23471 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRZ1P23471 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRZ1P23471 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRZ1P23471 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRZ1P23471 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRZ1P23471 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRZ1P23471 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRZ1P23471 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRZ1P23471 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRZ1P23471 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRZ1P23471 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRZ1P23471 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRZ1P23471 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRZ1P23471 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRZ1P23471 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRZ1P23471 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRZ1P23471 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRZ1P23471 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRZ1P23471 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRZ1P23471 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRZ1P23471 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
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