Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPREP23469 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPREP23469 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPREP23469 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPREP23469 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPREP23469 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPREP23469 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPREP23469 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPREP23469 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPREP23469 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPREP23469 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPREP23469 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPREP23469 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPREP23469 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPREP23469 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPREP23469 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPREP23469 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPREP23469 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPREP23469 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPREP23469 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPREP23469 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPREP23469 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPREP23469 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPREP23469 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPREP23469 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPREP23469 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPREP23469 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPREP23469 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPREP23469 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPREP23469 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPREP23469 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPREP23469 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPREP23469 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPREP23469 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPREP23469 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPREP23469 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPREP23469 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPREP23469 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPREP23469 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPREP23469 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPREP23469 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPREP23469 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPREP23469 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPREP23469 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPREP23469 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPREP23469 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPREP23469 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPREP23469 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPREP23469 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPREP23469 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPREP23469 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPREP23469 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPREP23469 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPREP23469 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPREP23469 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPREP23469 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPREP23469 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPREP23469 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPREP23469 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPREP23469 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPREP23469 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPREP23469 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPREP23469 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPREP23469 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPREP23469 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPREP23469 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPREP23469 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPREP23469 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPREP23469 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPREP23469 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPREP23469 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPREP23469 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPREP23469 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPREP23469 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPREP23469 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPREP23469 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPREP23469 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPREP23469 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPREP23469 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPREP23469 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPREP23469 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPREP23469 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPREP23469 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPREP23469 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPREP23469 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPREP23469 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPREP23469 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPREP23469 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPREP23469 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPREP23469 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPREP23469 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPREP23469 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPREP23469 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPREP23469 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPREP23469 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPREP23469 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPREP23469 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPREP23469 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPREP23469 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPREP23469 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms