Protein–RNA interactions for Protein: P21796

VDAC1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC1P21796 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VDAC1P21796 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VDAC1P21796 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VDAC1P21796 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VDAC1P21796 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VDAC1P21796 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VDAC1P21796 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VDAC1P21796 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VDAC1P21796 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VDAC1P21796 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VDAC1P21796 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VDAC1P21796 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VDAC1P21796 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VDAC1P21796 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VDAC1P21796 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VDAC1P21796 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VDAC1P21796 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VDAC1P21796 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VDAC1P21796 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VDAC1P21796 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VDAC1P21796 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VDAC1P21796 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VDAC1P21796 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VDAC1P21796 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VDAC1P21796 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VDAC1P21796 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VDAC1P21796 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VDAC1P21796 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VDAC1P21796 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VDAC1P21796 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VDAC1P21796 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VDAC1P21796 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VDAC1P21796 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VDAC1P21796 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VDAC1P21796 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VDAC1P21796 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VDAC1P21796 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VDAC1P21796 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VDAC1P21796 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VDAC1P21796 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VDAC1P21796 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VDAC1P21796 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VDAC1P21796 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VDAC1P21796 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VDAC1P21796 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VDAC1P21796 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VDAC1P21796 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VDAC1P21796 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VDAC1P21796 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VDAC1P21796 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VDAC1P21796 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VDAC1P21796 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VDAC1P21796 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VDAC1P21796 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VDAC1P21796 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VDAC1P21796 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VDAC1P21796 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VDAC1P21796 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VDAC1P21796 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VDAC1P21796 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VDAC1P21796 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VDAC1P21796 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VDAC1P21796 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VDAC1P21796 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VDAC1P21796 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VDAC1P21796 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VDAC1P21796 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VDAC1P21796 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VDAC1P21796 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VDAC1P21796 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VDAC1P21796 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VDAC1P21796 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VDAC1P21796 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VDAC1P21796 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VDAC1P21796 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VDAC1P21796 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VDAC1P21796 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VDAC1P21796 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VDAC1P21796 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms