Protein–RNA interactions for Protein: P21283

ATP6V1C1, V-type proton ATPase subunit C 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1C1P21283 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP6V1C1P21283 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP6V1C1P21283 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP6V1C1P21283 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP6V1C1P21283 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP6V1C1P21283 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP6V1C1P21283 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP6V1C1P21283 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP6V1C1P21283 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP6V1C1P21283 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP6V1C1P21283 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP6V1C1P21283 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP6V1C1P21283 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP6V1C1P21283 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP6V1C1P21283 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP6V1C1P21283 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP6V1C1P21283 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP6V1C1P21283 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP6V1C1P21283 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP6V1C1P21283 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP6V1C1P21283 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP6V1C1P21283 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP6V1C1P21283 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP6V1C1P21283 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP6V1C1P21283 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP6V1C1P21283 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP6V1C1P21283 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATP6V1C1P21283 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP6V1C1P21283 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP6V1C1P21283 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP6V1C1P21283 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP6V1C1P21283 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP6V1C1P21283 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP6V1C1P21283 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP6V1C1P21283 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP6V1C1P21283 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP6V1C1P21283 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP6V1C1P21283 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP6V1C1P21283 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP6V1C1P21283 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP6V1C1P21283 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP6V1C1P21283 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP6V1C1P21283 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP6V1C1P21283 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP6V1C1P21283 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP6V1C1P21283 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP6V1C1P21283 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP6V1C1P21283 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP6V1C1P21283 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP6V1C1P21283 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP6V1C1P21283 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP6V1C1P21283 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP6V1C1P21283 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP6V1C1P21283 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ATP6V1C1P21283 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP6V1C1P21283 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP6V1C1P21283 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP6V1C1P21283 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP6V1C1P21283 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP6V1C1P21283 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP6V1C1P21283 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP6V1C1P21283 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP6V1C1P21283 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP6V1C1P21283 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP6V1C1P21283 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP6V1C1P21283 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP6V1C1P21283 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP6V1C1P21283 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP6V1C1P21283 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP6V1C1P21283 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP6V1C1P21283 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP6V1C1P21283 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP6V1C1P21283 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP6V1C1P21283 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP6V1C1P21283 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP6V1C1P21283 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP6V1C1P21283 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP6V1C1P21283 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP6V1C1P21283 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP6V1C1P21283 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP6V1C1P21283 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP6V1C1P21283 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP6V1C1P21283 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP6V1C1P21283 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP6V1C1P21283 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP6V1C1P21283 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP6V1C1P21283 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP6V1C1P21283 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP6V1C1P21283 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP6V1C1P21283 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP6V1C1P21283 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP6V1C1P21283 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP6V1C1P21283 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP6V1C1P21283 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP6V1C1P21283 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP6V1C1P21283 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP6V1C1P21283 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP6V1C1P21283 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP6V1C1P21283 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP6V1C1P21283 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms