Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTNP21246 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTNP21246 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTNP21246 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTNP21246 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTNP21246 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTNP21246 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTNP21246 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTNP21246 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTNP21246 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTNP21246 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTNP21246 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTNP21246 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTNP21246 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTNP21246 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTNP21246 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTNP21246 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTNP21246 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTNP21246 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTNP21246 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTNP21246 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTNP21246 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTNP21246 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTNP21246 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTNP21246 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTNP21246 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTNP21246 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTNP21246 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTNP21246 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTNP21246 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTNP21246 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTNP21246 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTNP21246 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTNP21246 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTNP21246 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTNP21246 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTNP21246 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTNP21246 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTNP21246 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTNP21246 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTNP21246 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTNP21246 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTNP21246 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTNP21246 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTNP21246 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTNP21246 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTNP21246 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTNP21246 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTNP21246 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTNP21246 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTNP21246 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTNP21246 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTNP21246 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTNP21246 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTNP21246 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTNP21246 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTNP21246 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTNP21246 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTNP21246 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTNP21246 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTNP21246 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTNP21246 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTNP21246 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTNP21246 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTNP21246 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTNP21246 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTNP21246 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTNP21246 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTNP21246 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTNP21246 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTNP21246 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTNP21246 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTNP21246 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTNP21246 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTNP21246 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTNP21246 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTNP21246 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTNP21246 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTNP21246 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTNP21246 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTNP21246 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTNP21246 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTNP21246 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTNP21246 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTNP21246 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTNP21246 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTNP21246 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTNP21246 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTNP21246 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTNP21246 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTNP21246 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTNP21246 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTNP21246 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTNP21246 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTNP21246 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTNP21246 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTNP21246 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTNP21246 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTNP21246 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTNP21246 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms